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全原子力場(chǎng)與RDF的分析是否有關(guān)系?如何對(duì)原子基團(tuán)或者分子進(jìn)行RDF分析?
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吉布斯系統(tǒng)Monte Carlo模擬的新手,想問(wèn)大俠們一個(gè)問(wèn)題。選擇全原子力場(chǎng)NERD進(jìn)行的輕烴類(lèi)氣液相平衡的模擬,想對(duì)平衡的液相進(jìn)行RDF分析,不知是分析分子(或者原子基團(tuán))之間的RDF還是原子之間的RDF?這與所選的力場(chǎng)是否有關(guān)系,選擇全原子力場(chǎng)就必須對(duì)原子基團(tuán)之間進(jìn)行分析還是可以對(duì)單一原子分析? 還有一個(gè)很頭疼的問(wèn)題,選擇原子作為SETS比較容易,但是選擇分子或者基團(tuán)的話,通過(guò)find patterns 可以選擇分子,但不能選擇基團(tuán),而且 這種sets 在RDF 或者是PCF中不能分析啊, 如何選擇原子基團(tuán)或者是分子并進(jìn)行RDF分析呢? ![]() |

鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

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