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全原子力場(chǎng)與RDF的分析是否有關(guān)系？如何對(duì)原子基團(tuán)或者分子進(jìn)行RDF分析？
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吉布斯系統(tǒng)Monte Carlo模擬的新手，想問大俠們一個(gè)問題。選擇全原子力場(chǎng)NERD進(jìn)行的輕烴類氣液相平衡的模擬，想對(duì)平衡的液相進(jìn)行RDF分析，不知是分析分子（或者原子基團(tuán)）之間的RDF還是原子之間的RDF？這與所選的力場(chǎng)是否有關(guān)系，選擇全原子力場(chǎng)就必須對(duì)原子基團(tuán)之間進(jìn)行分析還是可以對(duì)單一原子分析？ 還有一個(gè)很頭疼的問題，選擇原子作為SETS比較容易，但是選擇分子或者基團(tuán)的話，通過find patterns 可以選擇分子，但不能選擇基團(tuán)，而且 這種sets 在RDF 或者是PCF中不能分析啊, 如何選擇原子基團(tuán)或者是分子并進(jìn)行RDF分析呢?   |
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9樓2011-06-30 02:57:11
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2樓2011-06-29 01:32:28
 嗯，就是說用如果用NERD（全原子力場(chǎng)）是可以分析原子之間的RDF的，我想分析基團(tuán)之間的RDF，但是不會(huì)選中原子基團(tuán)作為SETS，使用的是MS4.0中Forcite/Anaysisi/Radial distribution function,用edit/select atoms還是edit/find patterns來選擇基團(tuán)? 具體怎么怎么選? 大俠能指點(diǎn)一下嗎? 還想問大俠一個(gè)問題。下圖是我分析原子之間的一個(gè)RDF，怎么調(diào)整都是很粗糙，我看文獻(xiàn)上的都是很平滑的漂亮的曲線，由于畢業(yè)限制需要發(fā)文章，所以很急，能糊弄過去就行啊 ，希望您能提出寶貴意見.提這么多的問題，真是麻煩大俠了，大俠肯相助，我可以把所以的金幣都贈(zèng)送給你  不勝感激！ |
3樓2011-06-29 07:40:52
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4樓2011-06-29 13:10:35
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