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flowers123銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助：關(guān)于二聚體的單點(diǎn)能
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我前最近在算一個(gè)二聚體的單點(diǎn)能，用z-矩陣寫的坐標(biāo)，發(fā)現(xiàn)計(jì)算單體能量時(shí)，加不加nosymm，結(jié)果一樣；但是計(jì)算總能量時(shí)，加了nosymm就低一點(diǎn)。 1、無論怎么調(diào)坐標(biāo)總能量都是這兩個(gè)值沒有變化。 2、發(fā)現(xiàn)計(jì)算單體時(shí)，用笛卡爾坐標(biāo)跟z矩陣還不一樣呢！ 3、是二聚體本來就是這樣，還是我寫錯(cuò)了�？嗖橘Y料沒有結(jié)果，希望明白人指導(dǎo)一下。 提前致謝，稍后奉上金幣！ [ Last edited by gmy1990 on 2011-7-11 at 18:14 ] |
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flowers123
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2樓2011-07-11 19:05:18
zhou2009
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
gmy1990(金幣+2): 非常感謝你對(duì)論壇的貢獻(xiàn)，獎(jiǎng)勵(lì)一下！ 2011-07-11 22:27:52
flowers123(金幣+5): 2011-07-12 20:30:40
gmy1990(金幣+2): 非常感謝你對(duì)論壇的貢獻(xiàn)，獎(jiǎng)勵(lì)一下！ 2011-07-11 22:27:52
flowers123(金幣+5): 2011-07-12 20:30:40
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雖然你的問題說明不夠詳細(xì)，但我看你對(duì)二聚體的單點(diǎn)能的計(jì)算還是對(duì)的。 計(jì)算單體能量時(shí)，加不加nosymm，結(jié)果應(yīng)是一樣的。 不加nosymm，是從分析分子的對(duì)稱性從而減少一些計(jì)算量。加nosymm，無非是多了些重復(fù)計(jì)算而已，結(jié)果是一樣的。些微的差別，是重復(fù)計(jì)算并不會(huì)完全對(duì)等，誤差累積的結(jié)果。 |
3樓2011-07-11 22:10:53
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其實(shí)差別還是很大的，用dz計(jì)算總能量加了nosymm之后比不加nosymm低了0.0005hatree，看起來不是很大，但是對(duì)結(jié)合能的影響非常明顯達(dá)到10%！ 我想問的是，二聚體計(jì)算總能量是不是都存在這個(gè)問題呢？ 如果坐標(biāo)寫的不太對(duì)的話，修改坐標(biāo)應(yīng)該能是加不加nosymm的能量逐漸接近的吧，可是我的總能量一直保持這兩個(gè)值不變。應(yīng)該說明，我的坐標(biāo)寫的是正確的吧？ 不好意思，麻煩各位幫我在分析一下，我明白之后，一定如數(shù)奉上金幣。拜謝! 特別感謝zhou2009大俠，我下載過你提供的不少資料，在此一并謝過。 |
5樓2011-07-12 20:45:16
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6樓2011-07-13 04:29:54
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7樓2011-07-13 10:33:52
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