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flowers123銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助：關(guān)于二聚體的單點能
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我前最近在算一個二聚體的單點能，用z-矩陣寫的坐標，發(fā)現(xiàn)計算單體能量時，加不加nosymm，結(jié)果一樣；但是計算總能量時，加了nosymm就低一點。 1、無論怎么調(diào)坐標總能量都是這兩個值沒有變化。 2、發(fā)現(xiàn)計算單體時，用笛卡爾坐標跟z矩陣還不一樣呢！ 3、是二聚體本來就是這樣，還是我寫錯了�？嗖橘Y料沒有結(jié)果，希望明白人指導(dǎo)一下。 提前致謝，稍后奉上金幣！ [ Last edited by gmy1990 on 2011-7-11 at 18:14 ] |
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flowers123
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2樓2011-07-11 19:05:18
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gmy1990(金幣+2): 非常感謝你對論壇的貢獻，獎勵一下！ 2011-07-11 22:27:52
flowers123(金幣+5): 2011-07-12 20:30:40
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flowers123(金幣+5): 2011-07-12 20:30:40
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雖然你的問題說明不夠詳細，但我看你對二聚體的單點能的計算還是對的。 計算單體能量時，加不加nosymm，結(jié)果應(yīng)是一樣的。 不加nosymm，是從分析分子的對稱性從而減少一些計算量。加nosymm，無非是多了些重復(fù)計算而已，結(jié)果是一樣的。些微的差別，是重復(fù)計算并不會完全對等，誤差累積的結(jié)果。 |
3樓2011-07-11 22:10:53
4樓2011-07-12 03:40:20
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5樓2011-07-12 20:45:16
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6樓2011-07-13 04:29:54
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7樓2011-07-13 10:33:52
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8樓2011-07-13 10:34:25
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