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liuwei78銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
提質(zhì)粒的問題
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下圖是我提的兩次質(zhì)粒。1、2泳道提的效果很差,不知道提出來的這個條帶是缺刻還是雙螺旋?3、4泳道條帶是明顯的,但是不清楚紅線圈內(nèi)的條帶是什么。希望大家?guī)臀医忉屜隆?br />
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專家顧問 (職業(yè)作家)
T.Shen
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專家經(jīng)驗: +57 |

銅蟲 (小有名氣)

銅蟲 (初入文壇)
金蟲 (正式寫手)

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質(zhì)粒提出來三個條帶是對的啊,線性,超螺旋,環(huán)狀,三種構(gòu)像的質(zhì)粒在瓊脂糖電泳的前后順序是超螺旋>線形>開環(huán),線形的質(zhì)粒在中間,而開環(huán)的質(zhì)粒在最后。 1 從細(xì)菌中大量提取的質(zhì)粒電泳時,不一定均出現(xiàn)三條帶,有時會出現(xiàn)兩條,甚至一條(一般是超螺旋的質(zhì)粒),這跟上樣量也有些關(guān)系。出現(xiàn)不同的結(jié)果都是由抽提質(zhì)粒時的操作手法造成的。如果嚴(yán)格按照操作步驟,超螺旋的質(zhì)粒會較多。 2 酶切將質(zhì)粒線性化以后,才可以用mark判斷大小。如果有三種構(gòu)像,可以用中間那條帶與mark比較判斷大小。 3 酶切后線性化條帶電泳時所處的位置就指示質(zhì)粒的大小 |

金蟲 (小有名氣)
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樓主這個圖可以說提得慘不忍睹。1,2的產(chǎn)量太低,帶型位置也更接近于缺刻質(zhì)粒;3,4的雜質(zhì)含量太高。所謂的質(zhì)粒3條帶應(yīng)該都在超螺旋質(zhì)粒的上方,下方出現(xiàn)很淡的帶,按分子克隆的說法,屬于質(zhì)粒在強變性條件下處理過長,變成無規(guī)則卷曲構(gòu)象,電泳大小約為正常帶型的一半。這種情況多見于煮沸法,堿法提取質(zhì)粒在加入溶液II,也就是NaOH+SDS溶液后靜置時間過長也會出現(xiàn),現(xiàn)在的試劑盒多采用減法,加入裂解液后溶液變澄清即可馬上加入中和液(溶液III),不必等待。但這種變形帶型對后續(xù)實驗基本無影響,也可以完全不理它。 給樓主的建議:注意一下菌體的濃度以及和抽提液的比例,3,4這樣的泳道應(yīng)該記下所用的原始培養(yǎng)基的體積,下次提取的時候減半;電泳marker不要用DL2000,差的比較遠(yuǎn)。 |

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