 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3408 | 回復(fù): 7 | ||
rainandstar銀蟲 (小有名氣)
|
[求助]
G09集群計算結(jié)果的chk文件轉(zhuǎn)換問題
|
|
各位好，我用的是系里的集群服務(wù)器，在Linux上進行G09計算的。現(xiàn)在我想看一下一個結(jié)構(gòu)的electrostatic potential surface，這個應(yīng)該在Gview中查看chk文件才能實現(xiàn)。我已得到chk文件，但是查了手冊才發(fā)現(xiàn)，在自己的電腦（windows）上，還要在轉(zhuǎn)換為fchk文件才行。 我根據(jù)手冊和版上幾個帖子中提到的方法進行了嘗試，結(jié)果失敗了，下面是我的過程，有經(jīng)驗的同學請幫忙看看問題出在什么地方，應(yīng)該怎么解決。謝謝 1，我首先嘗試SSH遠程登錄到cluster上直接實現(xiàn)，具體為進入完成該任務(wù)的lanth，進入其中g(shù)09的目錄，輸入formchk /home/name/**.chk /home/name/**fchk，給出的提示是command not found。 2，我把得到的chk文件下到自己的電腦上，然后用g9w中的formchk時也不能轉(zhuǎn)換格式，顯示為： Bad file opened by FileIO: Unit=2 I= 2 FPrev=40960 FCur= 0. FileIO: IOper= 9 IFileNo<1>= 2 Len= 0 IPos= 0 Q= 4573204 Error termination in NtrErr: NtrErr called from FileIO. 不知道這個是什么原因。 3，接著上面的情況，我直接把chk文件復(fù)制到\g09w\scratch中，然后運行formchk c:\g09w\scratch\**.chk c:\g09w\scratch\**fchk，屏幕顯示為： fname=c:\g09w\scratch\**.chk fd = -1 fname=c:\g09w\scratch\**.chk fd = -1 open-new-file open-new-file:Invalid argument 總結(jié)下來，感覺在SSH上遠程用Linux或者在自己電腦上有G09 windows應(yīng)該都是可以的，但是我不知道哪里的命令寫的不對。恩，就是這樣了，請多指教。thanks |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
深圳理工大學招聘AI4Science與分子模擬方向科研人員
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
全獎博士 英國利物浦大學 × 臺灣清華大學 聯(lián)合培養(yǎng)
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
物理化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有175人回復(fù)
-
尋博導(dǎo)
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
基金正文30頁指的是報告正文還是整個申請書
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
哈爾濱工業(yè)大學（深圳）綠色化學團隊招收2026年秋季入學博士生
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
澳大利亞昆士蘭科技大學PhD博士獎學金
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 已經(jīng)計算完成的chk文件還能使用SSH進行chk到fchk的轉(zhuǎn)換嗎
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 集群和進程的問題
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 用高斯09計算保存的chk文件，打不開，怎么回事？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- formchk轉(zhuǎn)換chk后只得到文件大小為0的fchk，求解
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 急求.chk文件轉(zhuǎn)formchk文件方法
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 計算化學便面勢能怎么在CHK文件里看
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】【已完結(jié)】G09計算單重三重激發(fā)態(tài)結(jié)果分析
已經(jīng)有19人回復(fù)
- 從Chk到 fchk文件轉(zhuǎn)換的命令行
已經(jīng)有5人回復(fù)
- g09linux與g03w計算效率對比
已經(jīng)有13人回復(fù)
- Gaussian 09 計算出來的chk文件無法轉(zhuǎn)化成fchk文件，求高手指教！
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 怎么用gaussview5.0.9打開g03算的chk文件
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 如何在計算機群上安裝G09
已經(jīng)有9人回復(fù)
- hydrophobic index是什么，如何計算？謝謝
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 在linux系統(tǒng)下 打不開chk文件
已經(jīng)有6人回復(fù)
- G09中計算AIM計算過渡金屬原子和氫原子間作用的問題
已經(jīng)有7人回復(fù)
- g09計算終止，沒有錯誤信息
已經(jīng)有5人回復(fù)
- Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.錯誤
已經(jīng)有6人回復(fù)
- Linux組建計算化學集群的教程
已經(jīng)有54人回復(fù)
- gaussian 激發(fā)態(tài)優(yōu)化后的chk文件和熒光計算后的chk文件有何不同
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助】用gaussian計算得到out文件和chk文件，怎么得到fch文件？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】我的CHK文件不見了。。。。
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】計算錯誤 幫忙看看
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】關(guān)于g09和g03的formchk和unfchk問題
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】chk文件轉(zhuǎn)換
已經(jīng)有18人回復(fù)
xj544
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 3649.3
- 散金: 20
- 紅花: 1
- 帖子: 152
- 在線: 84.7小時
- 蟲號: 945655
- 注冊: 2010-01-20
- 專業(yè): 理論和計算化學
2樓2011-09-02 15:06:52
xj544
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 3649.3
- 散金: 20
- 紅花: 1
- 帖子: 152
- 在線: 84.7小時
- 蟲號: 945655
- 注冊: 2010-01-20
- 專業(yè): 理論和計算化學
C-Young3樓2011-09-02 15:07:39
yuanzou3015
銀蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 350.5
- 紅花: 1
- 帖子: 54
- 在線: 69.5小時
- 蟲號: 94057
- 注冊: 2005-09-25
- 專業(yè): 理論和計算化學
|
非常感謝xj544 。 我也遇到了同樣的問題，以前在遠程上用g03計算完，可以直接輸入 formchk ***.chk，將chk文件轉(zhuǎn)化成fchk文件。 最近換成g09計算后，每次輸入formchk ***.chk，都會出現(xiàn)下面的錯誤： Error termination in NtrErr: NtrErr called from FileIO 網(wǎng)上搜索了一遍后，剛按照xj544介紹的方法，將命令改成絕對路徑，即/opt/g09/formchk ***.chk(g09裝在opt文件下)，就可以了。 建議樓主也試試吧。 再次感謝。 |
4樓2011-11-01 16:09:39
yoyo103108
銅蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 483.5
- 帖子: 80
- 在線: 48小時
- 蟲號: 1190996
- 注冊: 2011-01-17
- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計算化學
5樓2014-07-08 10:50:06
rainandstar
銀蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 315.5
- 紅花: 2
- 帖子: 91
- 在線: 69.8小時
- 蟲號: 1385353
- 注冊: 2011-08-31
- 專業(yè): 質(zhì)譜分析
6樓2014-07-09 23:28:13
wfmi
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 812.6
- 散金: 5
- 帖子: 179
- 在線: 117.9小時
- 蟲號: 1291792
- 注冊: 2011-05-10
- 性別: GG
- 專業(yè): 化工系統(tǒng)工程
7樓2016-01-13 21:45:22
8樓2017-03-04 23:27:46
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 rainandstar 的主題更新
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研]
 271材料工程求調(diào)劑
+3
|
.6lL 2026-03-18 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 材料專碩306英一數(shù)二 +10 | z1z2z3879 2026-03-16 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 材料專碩274一志愿陜西師范大學求調(diào)劑 +6 | 薛云鵬 2026-03-13 | 6/300 |
|
|
[考研] 070300化學319求調(diào)劑 +6 | 錦鯉0909 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑，一志愿華南理工大學071005 +4 | ioodiiij 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | 冷笙123 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 301求調(diào)劑 +9 | yy要上岸呀 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +11 | zjl的號 2026-03-16 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +6 | 世界首富 2026-03-11 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +6 | 孔志浩 2026-03-12 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 285化工學碩求調(diào)劑（081700） +9 | 柴郡貓_ 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中師范071000，325求調(diào)劑 +6 | RuitingC 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 22408總分284求調(diào)劑 +3 | InAspic 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 本科南京大學一志愿川大藥學327 +3 | 麥田耕者 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 復(fù)試調(diào)劑 +4 | z1z2z3879 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 315求調(diào)劑 +9 | 小羊小羊_ 2026-03-11 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 26調(diào)劑/材料科學與工程/總分295/求收留 +9 | 2026調(diào)劑俠 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +5 | 一定有學上- 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +3 | 李政瑩 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 152697 2026-03-12 | 4/200 |
|