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rainandstar銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
G09集群計算結(jié)果的chk文件轉(zhuǎn)換問題
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各位好，我用的是系里的集群服務(wù)器，在Linux上進行G09計算的�，F(xiàn)在我想看一下一個結(jié)構(gòu)的electrostatic potential surface，這個應(yīng)該在Gview中查看chk文件才能實現(xiàn)。我已得到chk文件，但是查了手冊才發(fā)現(xiàn)，在自己的電腦（windows）上，還要在轉(zhuǎn)換為fchk文件才行。 我根據(jù)手冊和版上幾個帖子中提到的方法進行了嘗試，結(jié)果失敗了，下面是我的過程，有經(jīng)驗的同學(xué)請幫忙看看問題出在什么地方，應(yīng)該怎么解決。謝謝 1，我首先嘗試SSH遠(yuǎn)程登錄到cluster上直接實現(xiàn)，具體為進入完成該任務(wù)的lanth，進入其中g(shù)09的目錄，輸入formchk /home/name/**.chk /home/name/**fchk，給出的提示是command not found。 2，我把得到的chk文件下到自己的電腦上，然后用g9w中的formchk時也不能轉(zhuǎn)換格式，顯示為： Bad file opened by FileIO: Unit=2 I= 2 FPrev=40960 FCur= 0. FileIO: IOper= 9 IFileNo<1>= 2 Len= 0 IPos= 0 Q= 4573204 Error termination in NtrErr: NtrErr called from FileIO. 不知道這個是什么原因。 3，接著上面的情況，我直接把chk文件復(fù)制到\g09w\scratch中，然后運行formchk c:\g09w\scratch\**.chk c:\g09w\scratch\**fchk，屏幕顯示為： fname=c:\g09w\scratch\**.chk fd = -1 fname=c:\g09w\scratch\**.chk fd = -1 open-new-file open-new-file:Invalid argument 總結(jié)下來，感覺在SSH上遠(yuǎn)程用Linux或者在自己電腦上有G09 windows應(yīng)該都是可以的，但是我不知道哪里的命令寫的不對。恩，就是這樣了，請多指教。thanks |
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xj544
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C-Young3樓2011-09-02 15:07:39
xj544
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2樓2011-09-02 15:06:52
yuanzou3015
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非常感謝xj544 。 我也遇到了同樣的問題，以前在遠(yuǎn)程上用g03計算完，可以直接輸入 formchk ***.chk，將chk文件轉(zhuǎn)化成fchk文件。 最近換成g09計算后，每次輸入formchk ***.chk，都會出現(xiàn)下面的錯誤： Error termination in NtrErr: NtrErr called from FileIO 網(wǎng)上搜索了一遍后，剛按照xj544介紹的方法，將命令改成絕對路徑，即/opt/g09/formchk ***.chk(g09裝在opt文件下)，就可以了。 建議樓主也試試吧。 再次感謝。 |
4樓2011-11-01 16:09:39
yoyo103108
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5樓2014-07-08 10:50:06
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