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Abinit 計算時rprim的疑惑
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把Abinti的指南看了一遍，有一些疑問。 1 在我計算一個晶體時怎么定義這個晶體的對稱性？是通過rprim這個參數(shù)嗎？ 2 如果我并不知道我要計算的晶體對稱性應(yīng)該如何操作，abinit會根據(jù)我給出的原子類型和數(shù)目自動優(yōu)化出對稱性嗎？ 3 同上問題，我不知道我要算的晶體各個原子的坐標(biāo)位置也可以隨便給讓后讓它自己relax嗎？ |
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pariah(金幣+1):謝謝參與
zzy870720z(金幣+3): 謝謝詳細(xì)指點 2011-09-03 17:16:54
pariah(金幣+1):謝謝參與
zzy870720z(金幣+3): 謝謝詳細(xì)指點 2011-09-03 17:16:54
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1 在我計算一個晶體時怎么定義這個晶體的對稱性？是通過rprim這個參數(shù)嗎？ 2 如果我并不知道我要計算的晶體對稱性應(yīng)該如何操作，abinit會根據(jù)我給出的原子類型和數(shù)目自動優(yōu)化出對稱性嗎？ 3 同上問題，我不知道我要算的晶體各個原子的坐標(biāo)位置也可以隨便給讓后讓它自己relax嗎？ 1、可以不用顯性的定義對稱性，輸入晶胞的參數(shù)和原子位置對應(yīng)的對稱性就定了。 2、一般我們必須給出原子的大致位置和晶胞結(jié)構(gòu)再讓程序優(yōu)化，目前好像還沒這么高自動化的優(yōu)化程序，即使優(yōu)化出來了可能也不是你想要的。 3、如果你不知道原子的大致位置，程序能優(yōu)化可結(jié)果估計也不會有太大的價值。原子坐標(biāo)和晶胞的參數(shù)文獻(xiàn)和一些數(shù)據(jù)庫里會有線索，你告訴程序的參數(shù)越詳細(xì)，你越能明白結(jié)果的意義。 一己之見，供參考。 |
2樓2011-09-03 02:17:12
3樓2011-09-03 10:26:36
4樓2011-09-14 10:59:58
5樓2011-09-21 15:38:59
6樓2011-09-25 14:39:59
mazuju028
木蟲 (正式寫手)
- 1ST強帖: 2
- 應(yīng)助: 30 (小學(xué)生)
- 貴賓: 0.141
- 金幣: 2794.4
- 帖子: 942
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- 蟲號: 668835
7樓2011-09-25 22:00:10
8樓2011-09-26 09:42:45
★ ★ ★
pariah(金幣+1): 謝謝參與
xueht987: 金幣+2, 謝謝回帖，鼓勵交流！ 2012-06-27 14:45:44
pariah(金幣+1): 謝謝參與
xueht987: 金幣+2, 謝謝回帖，鼓勵交流！ 2012-06-27 14:45:44
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1 在我計算一個晶體時怎么定義這個晶體的對稱性？是通過rprim這個參數(shù)嗎？ a: 晶體對稱性是通過spgroup給出的，從1-230對應(yīng)什么對稱性，參見這里 http://www.abinit.org/documentat ... pgrdescription.html 對于同一個spgroup 的axis方向，用另一個參數(shù)spgaxor 給出，有時也用到brvltt和spgorig。 對于一個空間群，這四個參數(shù)可以完全確定晶體對稱性。 此時，不必使用rprim. 2 如果我并不知道我要計算的晶體對稱性應(yīng)該如何操作，abinit會根據(jù)我給出的原子類型和數(shù)目自動優(yōu)化出對稱性嗎？ 如果不知道對稱性，可以到這里去查對稱性：http://cst-www.nrl.navy.mil/lattice/，或者找文獻(xiàn)查出對稱性。 Abinit會根據(jù)你的acell, rprim和原子的坐標(biāo)(xcart或者xred/xangst)自動得出對稱性，只要查一下輸出文件(.out)，找到spgroup對應(yīng)的數(shù)字（1-230）即可 3 同上問題，我不知道我要算的晶體各個原子的坐標(biāo)位置也可以隨便給讓后讓它自己relax嗎？ 沒太看懂，沒有原子坐標(biāo)你要計算的是什么？可否給個input file看一下？我印象中原子坐標(biāo)是個必要的輸入?yún)?shù)（就好比精度控制也是必須輸入的一樣） |
9樓2012-06-26 23:41:23
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