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Abinit 計算時rprim的疑惑
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把Abinti的指南看了一遍,有一些疑問。 1 在我計算一個晶體時怎么定義這個晶體的對稱性?是通過rprim這個參數(shù)嗎? 2 如果我并不知道我要計算的晶體對稱性應(yīng)該如何操作,abinit會根據(jù)我給出的原子類型和數(shù)目自動優(yōu)化出對稱性嗎? 3 同上問題,我不知道我要算的晶體各個原子的坐標(biāo)位置也可以隨便給讓后讓它自己relax嗎? |
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1 在我計算一個晶體時怎么定義這個晶體的對稱性?是通過rprim這個參數(shù)嗎? a: 晶體對稱性是通過spgroup給出的,從1-230對應(yīng)什么對稱性,參見這里 http://www.abinit.org/documentat ... pgrdescription.html 對于同一個spgroup 的axis方向,用另一個參數(shù)spgaxor 給出,有時也用到brvltt和spgorig。 對于一個空間群,這四個參數(shù)可以完全確定晶體對稱性。 此時,不必使用rprim. 2 如果我并不知道我要計算的晶體對稱性應(yīng)該如何操作,abinit會根據(jù)我給出的原子類型和數(shù)目自動優(yōu)化出對稱性嗎? 如果不知道對稱性,可以到這里去查對稱性:http://cst-www.nrl.navy.mil/lattice/,或者找文獻查出對稱性。 Abinit會根據(jù)你的acell, rprim和原子的坐標(biāo)(xcart或者xred/xangst)自動得出對稱性,只要查一下輸出文件(.out),找到spgroup對應(yīng)的數(shù)字(1-230)即可 3 同上問題,我不知道我要算的晶體各個原子的坐標(biāo)位置也可以隨便給讓后讓它自己relax嗎? 沒太看懂,沒有原子坐標(biāo)你要計算的是什么?可否給個input file看一下?我印象中原子坐標(biāo)是個必要的輸入?yún)?shù)(就好比精度控制也是必須輸入的一樣) |
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1 在我計算一個晶體時怎么定義這個晶體的對稱性?是通過rprim這個參數(shù)嗎? 2 如果我并不知道我要計算的晶體對稱性應(yīng)該如何操作,abinit會根據(jù)我給出的原子類型和數(shù)目自動優(yōu)化出對稱性嗎? 3 同上問題,我不知道我要算的晶體各個原子的坐標(biāo)位置也可以隨便給讓后讓它自己relax嗎? 1、可以不用顯性的定義對稱性,輸入晶胞的參數(shù)和原子位置對應(yīng)的對稱性就定了。 2、一般我們必須給出原子的大致位置和晶胞結(jié)構(gòu)再讓程序優(yōu)化,目前好像還沒這么高自動化的優(yōu)化程序,即使優(yōu)化出來了可能也不是你想要的。 3、如果你不知道原子的大致位置,程序能優(yōu)化可結(jié)果估計也不會有太大的價值。原子坐標(biāo)和晶胞的參數(shù)文獻和一些數(shù)據(jù)庫里會有線索,你告訴程序的參數(shù)越詳細,你越能明白結(jié)果的意義。 一己之見,供參考。 |
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