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pariah銅蟲(chóng) (小有名氣)
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Abinit 計(jì)算時(shí)rprim的疑惑
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把Abinti的指南看了一遍，有一些疑問(wèn)。 1 在我計(jì)算一個(gè)晶體時(shí)怎么定義這個(gè)晶體的對(duì)稱(chēng)性？是通過(guò)rprim這個(gè)參數(shù)嗎？ 2 如果我并不知道我要計(jì)算的晶體對(duì)稱(chēng)性應(yīng)該如何操作，abinit會(huì)根據(jù)我給出的原子類(lèi)型和數(shù)目自動(dòng)優(yōu)化出對(duì)稱(chēng)性嗎？ 3 同上問(wèn)題，我不知道我要算的晶體各個(gè)原子的坐標(biāo)位置也可以隨便給讓后讓它自己relax嗎？ |
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pariah(金幣+1):謝謝參與
zzy870720z(金幣+3): 謝謝詳細(xì)指點(diǎn) 2011-09-03 17:16:54
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zzy870720z(金幣+3): 謝謝詳細(xì)指點(diǎn) 2011-09-03 17:16:54
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1 在我計(jì)算一個(gè)晶體時(shí)怎么定義這個(gè)晶體的對(duì)稱(chēng)性？是通過(guò)rprim這個(gè)參數(shù)嗎？ 2 如果我并不知道我要計(jì)算的晶體對(duì)稱(chēng)性應(yīng)該如何操作，abinit會(huì)根據(jù)我給出的原子類(lèi)型和數(shù)目自動(dòng)優(yōu)化出對(duì)稱(chēng)性嗎？ 3 同上問(wèn)題，我不知道我要算的晶體各個(gè)原子的坐標(biāo)位置也可以隨便給讓后讓它自己relax嗎？ 1、可以不用顯性的定義對(duì)稱(chēng)性，輸入晶胞的參數(shù)和原子位置對(duì)應(yīng)的對(duì)稱(chēng)性就定了。 2、一般我們必須給出原子的大致位置和晶胞結(jié)構(gòu)再讓程序優(yōu)化，目前好像還沒(méi)這么高自動(dòng)化的優(yōu)化程序，即使優(yōu)化出來(lái)了可能也不是你想要的。 3、如果你不知道原子的大致位置，程序能優(yōu)化可結(jié)果估計(jì)也不會(huì)有太大的價(jià)值。原子坐標(biāo)和晶胞的參數(shù)文獻(xiàn)和一些數(shù)據(jù)庫(kù)里會(huì)有線(xiàn)索，你告訴程序的參數(shù)越詳細(xì)，你越能明白結(jié)果的意義。 一己之見(jiàn)，供參考。 |
2樓2011-09-03 02:17:12
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pariah(金幣+1): 謝謝參與
xueht987: 金幣+2, 謝謝回帖，鼓勵(lì)交流！ 2012-06-27 14:45:44
pariah(金幣+1): 謝謝參與
xueht987: 金幣+2, 謝謝回帖，鼓勵(lì)交流！ 2012-06-27 14:45:44
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1 在我計(jì)算一個(gè)晶體時(shí)怎么定義這個(gè)晶體的對(duì)稱(chēng)性？是通過(guò)rprim這個(gè)參數(shù)嗎？ a: 晶體對(duì)稱(chēng)性是通過(guò)spgroup給出的，從1-230對(duì)應(yīng)什么對(duì)稱(chēng)性，參見(jiàn)這里 http://www.abinit.org/documentat ... pgrdescription.html 對(duì)于同一個(gè)spgroup 的axis方向，用另一個(gè)參數(shù)spgaxor 給出，有時(shí)也用到brvltt和spgorig。 對(duì)于一個(gè)空間群，這四個(gè)參數(shù)可以完全確定晶體對(duì)稱(chēng)性。 此時(shí)，不必使用rprim. 2 如果我并不知道我要計(jì)算的晶體對(duì)稱(chēng)性應(yīng)該如何操作，abinit會(huì)根據(jù)我給出的原子類(lèi)型和數(shù)目自動(dòng)優(yōu)化出對(duì)稱(chēng)性嗎？ 如果不知道對(duì)稱(chēng)性，可以到這里去查對(duì)稱(chēng)性：http://cst-www.nrl.navy.mil/lattice/，或者找文獻(xiàn)查出對(duì)稱(chēng)性。 Abinit會(huì)根據(jù)你的acell, rprim和原子的坐標(biāo)(xcart或者xred/xangst)自動(dòng)得出對(duì)稱(chēng)性，只要查一下輸出文件(.out)，找到spgroup對(duì)應(yīng)的數(shù)字（1-230）即可 3 同上問(wèn)題，我不知道我要算的晶體各個(gè)原子的坐標(biāo)位置也可以隨便給讓后讓它自己relax嗎？ 沒(méi)太看懂，沒(méi)有原子坐標(biāo)你要計(jì)算的是什么？可否給個(gè)input file看一下？我印象中原子坐標(biāo)是個(gè)必要的輸入?yún)?shù)（就好比精度控制也是必須輸入的一樣） |
9樓2012-06-26 23:41:23
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