 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3175 | 回復(fù): 11 | |||||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||||
yaoo_1木蟲 (小有名氣)
|
[求助]
關(guān)于建模結(jié)構(gòu)優(yōu)化的一些問題
|
||||
|
新手發(fā)問 請(qǐng)問一下我想做有特定形狀的缺陷的2x2x2的 周期性 的結(jié)構(gòu)，材料是使用硅，要計(jì)算態(tài)密度，聲子譜，能帶結(jié)構(gòu) 有試著先做一個(gè)的3x3x3超晶胞10顆缺陷的結(jié)構(gòu)，在CPU i5- 2400 內(nèi)存為8G的電腦上面跑不過(guò)跑了一天的工作就失敗了，看來(lái)電腦不夠力 結(jié)構(gòu)優(yōu)化第一次點(diǎn)選ultralfine，180 eV的k點(diǎn)4x4x4所做出來(lái)的晶格常數(shù)為5.39 更改不同的截止能量后要看能量收斂的程度 看到文獻(xiàn)都會(huì)用 截止能量 跟 能量 的關(guān)系 那么是要看 final energy 嗎還是迭代之后的 total energy 呢 有試著用硅晶胞邊常設(shè)為5.4309然后用原始晶胞去最佳化分別選用LDA跟GGA- PBE的截止能量各從100～1000 k點(diǎn)的1x1x1 贗勢(shì)為ultrasoft 其他都是預(yù)設(shè)值，晶體越大所需k點(diǎn)數(shù)越少 看到一些教學(xué)提到硅材料截止能量不需要太高大概在200 eV的的截止能量就能得到準(zhǔn)確的數(shù)值？ 而得出的總能量我是看最后一次出現(xiàn)的final energy 而總能量LDA的大約都在-102.xx eV的左右GGA大約在-102.90xx LDA的會(huì)低估晶格常數(shù)GGA會(huì)高估晶格常數(shù) 回歸正題想問一下必須先用優(yōu)化過(guò)后的結(jié)構(gòu)去建立的2x2x2的超晶胞 再刪除我想要的原子數(shù)，(還是說(shuō)必須要有真空層嗎，看到教學(xué)文件指出非周期性的的分子或晶體才需要使用真空層預(yù)防波函數(shù)重疊)，再進(jìn)行一次結(jié)構(gòu)最佳化計(jì)算我要的物性，選用的截止能量跟k-point都是沿用這樣對(duì)嗎？ 題外話，另外想問一下因?yàn)榇蟾攀且话兕w原子，以現(xiàn)在的Core i7 3.4 GHz的四核8線的電腦大概需要多少時(shí)間有哪位高手知道嗎 希望大家一起交流指教，謝謝 [ Last edited by yaoo_1 on 2011-9-9 at 01:01 ] |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 MaterialStudio學(xué)習(xí)使用 | 第一性原理 | 雜七雜八 |
» 猜你喜歡
309求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
一志愿南航 335分 | 0856 | GPA 4.07 | 有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
求化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
085600，材料與化工321分求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
0703 化學(xué) 求調(diào)劑，一志愿山東大學(xué) 342 分
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿南開大學(xué)0710生物學(xué)359求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
085600，專業(yè)課化工原理，320分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
材料與化工272求調(diào)劑
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
290求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- surflex-dock對(duì)接問題
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 計(jì)算Cl-在Fe表面吸附問題時(shí)體系加電荷方法
已經(jīng)有27人回復(fù)
- 有關(guān)MS 的建模 優(yōu)化及計(jì)算的一些問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【活動(dòng)or資源】vasp晶體結(jié)構(gòu)優(yōu)化
已經(jīng)有142人回復(fù)
- 關(guān)于ATK建模時(shí)原子摻雜的問題
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【討論】分子模擬還是同源建模
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 【討論】如何利用gaussian來(lái)解釋關(guān)于不同合成條件下得到的兩種配合物（50金幣）
已經(jīng)有20人回復(fù)
賀儀
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 1ST強(qiáng)帖: 5
- 應(yīng)助: 93 (初中生)
- 貴賓: 0.636
- 金幣: 5937
- 散金: 1063
- 紅花: 38
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 2499
- 在線: 588.7小時(shí)
- 蟲號(hào): 995125
- 注冊(cè): 2010-04-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
7樓2011-09-10 10:16:29
賀儀
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 1ST強(qiáng)帖: 5
- 應(yīng)助: 93 (初中生)
- 貴賓: 0.636
- 金幣: 5937
- 散金: 1063
- 紅花: 38
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 2499
- 在線: 588.7小時(shí)
- 蟲號(hào): 995125
- 注冊(cè): 2010-04-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
yaoo_1(金幣+1): 感謝版主的指導(dǎo) 2011-09-09 11:45:01
gzqdyouxia(金幣+2): 謝謝指教 2011-09-09 16:12:30
yaoo_1(金幣+1): 感謝版主的指導(dǎo) 2011-09-09 11:45:01
gzqdyouxia(金幣+2): 謝謝指教 2011-09-09 16:12:30
|
說(shuō)一下你的設(shè)置：ultralfine，180 eV的k點(diǎn)4x4x4所做出來(lái)的晶格常數(shù)為5.39 這里很不和諧！ultralfine，180 eV這兩個(gè)更是了，180太低了 你的總能與計(jì)算的這個(gè)截?cái)嗄懿灰粯�，注意概念，這兩個(gè)沒啥大直接的關(guān)系。 一般優(yōu)化分幾步進(jìn)行， 首先進(jìn)行一次粗糙的優(yōu)化，用mid就行，大概300ev，k點(diǎn)可以少一點(diǎn) 然后進(jìn)行第二步，選擇fine 450eV 4x4x4,也就差不多了 一步優(yōu)化對(duì)于粗糙的結(jié)構(gòu)很難收斂 |
2樓2011-09-09 10:09:15
yaoo_1
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 2125.1
- 帖子: 286
- 在線: 117.5小時(shí)
- 蟲號(hào): 1051851
- 注冊(cè): 2010-07-04
- 專業(yè): 微/納機(jī)械系統(tǒng)
3樓2011-09-09 11:13:53
yaoo_1
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 2125.1
- 帖子: 286
- 在線: 117.5小時(shí)
- 蟲號(hào): 1051851
- 注冊(cè): 2010-07-04
- 專業(yè): 微/納機(jī)械系統(tǒng)
|
漏掉一些訊息 有看一些文獻(xiàn)寫說(shuō)截止能量在多少時(shí)總能跟晶格常數(shù)會(huì)有最佳收斂的效果 類似像這樣 我要做的模型是中心去掉一顆及五顆原子的模型 昨天有看到一些討論串說(shuō) 超晶胞是對(duì)原胞的擴(kuò)展，比如3*3，2*2等，擴(kuò)展而成新的重復(fù)單元。超晶胞一般用于研究缺陷，比如空位濃度，或者摻雜原子等。 例如：如果你的晶胞有100個(gè)原子，空位濃度為0.01，那么就要把晶胞擴(kuò)展10倍，然后，從supercell里面去除一個(gè)原子。這樣的空位濃度才等于0.01 那我一開始模型就建錯(cuò)了嗎  學(xué)習(xí)了看了一些教學(xué)好像沒提到版主說(shuō)的要兩次優(yōu)化 |
4樓2011-09-09 11:34:44
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料與化工272求調(diào)劑 +16 | 阿斯蒂芬2004 2026-03-28 | 16/800 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 求調(diào)劑 +4 | QiMing7 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿哈爾濱工業(yè)大學(xué)材料與化工方向336分 +10 | 辰沐5211314 2026-03-26 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑（080500） +7 | A child 2026-03-27 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 291求調(diào)劑 +7 | Y-cap 2026-03-29 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +7 | 小蠟新筆 2026-03-29 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +10 | 15188958825 2026-03-25 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 085600 材料與化工 329分求調(diào)劑 +14 | Mr. Z 2026-03-25 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境工程 085701，267求調(diào)劑 +6 | minht 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 298求調(diào)劑 +4 | 種圣賜 2026-03-28 | 4/200 |
|
|
|
[碩博家園] 招收生物學(xué)/細(xì)胞生物學(xué)調(diào)劑 +4 | IceGuo 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑 +3 | A child 2026-03-28 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 346求調(diào)劑 一志愿070303有機(jī)化學(xué) +3 | 蘿卜燉青菜 2026-03-28 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +12 | PolarBear11 2026-03-26 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +7 | 墨墨漠 2026-03-27 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)求調(diào)劑，各位老師看看我！�。� +5 | 祁祺祺 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 298調(diào)劑 +3 | jiyingjie123 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院-光纖傳感課題組招生-中國(guó)科學(xué)院大學(xué)、深圳理工大學(xué)聯(lián)培 +5 | YangTyu1 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)調(diào)劑一志愿上海交通大學(xué)336分-本科上海211 +4 | 小魚愛有機(jī) 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 085404電子信息284分求調(diào)劑
+4
|
13659058978 2026-03-24 | 4/200 |
|