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wanhscn木蟲 (職業(yè)作家)
哲學(xué)@草根
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【轉(zhuǎn)】我在SDS-PAGE中所犯的錯(cuò)誤,歡迎補(bǔ)充! 已有29人參與
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(1)我的SDS-PAGE 用了半年卻還能用。10%SDS溶液兩年了目前好著呢,他是結(jié)晶的用前熱水浴溶解即可,常溫保存。AP用一個(gè)月肯定沒(méi)有問(wèn)題。TEMED好像用了10年了,沒(méi)有問(wèn)題,不可思議。但快過(guò)期的甲叉試劑會(huì)使膠凝固時(shí),梳子的齒處長(zhǎng)短不齊。 ________________________________________ (2)我們用的是Invitrogen的kit, 我做的不多,只做過(guò)GFP,也列下錯(cuò)誤: 1. 用錯(cuò)了running buffer,跑出來(lái)的帶呈彩虹弧形,而且跑得非常慢 2. 第一次抗體濃度過(guò)高(1/500),跑出來(lái)的帶看不出濃度差異,第二次一級(jí)抗體和耳機(jī)抗體的稀釋比率分別是(1/1000和1/4000),效果比較理想。 3.目前正在進(jìn)行中的是一次跑兩批蛋白(兩張膠),但是出來(lái)結(jié)果一張有一張白版,不知道是什么原因。。。 ________________________________________ (3)我也是剛進(jìn)實(shí)驗(yàn)室,盡犯些不該犯得小卻致命的錯(cuò)誤,每次都懊惱得想撞墻,現(xiàn)得一結(jié)論,做實(shí)驗(yàn)一定到認(rèn)真,每次都把protocol重寫一邊,做到哪劃到哪,省得出錯(cuò)。 ________________________________________ (4)今天第一次灌膠 所用設(shè)備為BIO-RAD 為防止漏膠 先在下層小心鋪一層速凝膠 (可在加TEMED之前取0.5ml分離膠液于另一小器皿中 然后加入10微升TEMED 然后灌速凝膠)靜置3分鐘后按常規(guī)方法灌分離膠 濃縮膠,結(jié)果未見漏膠情況發(fā)生。另外本人在流水沖洗下拔梳子 結(jié)果未見梳孔歪斜情況發(fā)生。第一次灌膠即比較成功。 ________________________________________ (5)我的錯(cuò)誤才搞笑,剛進(jìn)實(shí)驗(yàn)室時(shí)做膠, 分離膠的配方和濃縮都弄成一樣的了. 還和別人討論錯(cuò)誤在哪里?怎么總是在分離膠就有帶 狂暈ing~~ ________________________________________ (6)一次有個(gè)師弟過(guò)來(lái)告訴我,他的SDS-PAGE上不了樣 我有些奇怪,過(guò)去看究竟,果然,他把樣品加入點(diǎn)樣孔之后,樣品不是沉到底部,而是象蘭色煙霧一樣從孔內(nèi)飄起來(lái),很快飄散干凈 感覺(jué)是樣品忽然變輕了,或者----電泳緩沖液變重了 后來(lái)發(fā)現(xiàn)原因是后者,原來(lái)他倒錯(cuò)了電泳緩沖液,把10倍的緩沖液倒進(jìn)了電泳槽,換回來(lái)就行了 ________________________________________ (7)我是新手正在做WB,我想請(qǐng)教各位高手一個(gè)問(wèn)題,我跑了三次膠每次都跑成哭臉,我求助過(guò)一些高手,說(shuō)可能是膠的底部有氣泡所致,我仔細(xì)看了我作的膠底部確實(shí)有許多氣泡,不論我怎么小心,有時(shí)在剛灌完分離膠時(shí)沒(méi)有明顯的氣泡,靜置一會(huì)后在膠的底部回出現(xiàn)許多小氣泡,這是什么原因呢? 膠凝固后體積會(huì)縮小。你可以加少許緩沖液后把槽傾斜,將氣泡趕掉。 ________________________________________ (8)我所犯的錯(cuò)誤也不少。 沒(méi)加BUFFER就煮蛋白樣品,結(jié)果全沉淀了,樣品只能扔掉。 轉(zhuǎn)膜忘了冰浴。不過(guò),作出來(lái)的結(jié)果沒(méi)有受到影響。 膜上面忘了標(biāo)記號(hào),做完了不知道是什么樣品了。建議用鉛筆在MARKER的位置標(biāo)個(gè)記號(hào)。 膠冬天氣溫低時(shí)不容易凝固,可以將AP,TEMED加倍,放在37度里。 AP,TEMED,每次配1ml都是放四度,最長(zhǎng)可能用了2個(gè)月沒(méi)問(wèn)題,SDS放在室溫,1年了,好像沒(méi)什么影響。 不要迷信進(jìn)口抗體,進(jìn)口抗體也會(huì)有時(shí)候做不出來(lái)。 ________________________________________ (9)我們也是加大AP濃度來(lái)加快凝膠速度的,不過(guò)有一次加大太多,凝得太快跑出來(lái)?xiàng)l帶有點(diǎn)歪歪扭扭的,不好看,建議30min左右聚合就可以了,太快也不好。 另外我們圖便宜,用了國(guó)產(chǎn)的槽。還不錯(cuò),跟借來(lái)的Bio-rad差不多,不用封,也不漏膠,只是沒(méi)有那個(gè)塑料剝膠板,便宜啊!這樣已經(jīng)不錯(cuò)了! ________________________________________ (10)我覺(jué)得防止記錯(cuò)加樣順序的方法可以是,MARKER兩邊加不同個(gè)數(shù)的樣本。如:MARKER左邊加了4個(gè),右邊加了5個(gè)。脫色完了,一看就明白了。 我就是這樣干的,個(gè)人有點(diǎn)懶,就經(jīng)常用這個(gè)方法 ________________________________________ (11)前些日子做SDSPAGE,做了兩天,犯了一大堆錯(cuò)誤,寫出來(lái)供大家借鑒: 1 聽有人說(shuō)瓊脂粉可以做封底膠,一試,漏了,還是用瓊脂糖吧。 2 AP用別人舊的,結(jié)果膠不干 3 A液,B液用舊的,不干。 結(jié)論:不要用別人的,一定要自已配,別怕浪費(fèi)。 4 前后Tris 的PH值搞錯(cuò),結(jié)果不凝 5 電泳時(shí)長(zhǎng)板接負(fù)極,反了 6 剝膠時(shí),忘了切角,自已都不記得哪是哪的。 再剝時(shí),分離膠與積層膠分開了,又搞不清什么是什么了。(可以用注射器向膠與玻璃之間注水,就可以很完整的剝下來(lái)。) ________________________________________ (12)我們也是bio-rad的不用封底, 對(duì)于APS個(gè)人覺(jué)得每個(gè)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該形成一種規(guī)則,就是所有配置的溶液都寫上日期和標(biāo)簽,并注明操作的人名,這樣是一種負(fù)責(zé)的態(tài)度,除了問(wèn)題很溶液找到來(lái)源,另外日期可以很明白判斷是否過(guò)期,APS一般一個(gè)星期4度下, 浪費(fèi)也是可恥的,不要把實(shí)驗(yàn)室的東西不擋自己的。另外配置母液的時(shí)候最好用超純水,這樣配置的緩沖液放一年都沒(méi)有什么問(wèn)題。 ________________________________________ (13)要想跑出好的膠,有條件的可以在最后加入APS或TEMED前,給混合的溶液脫脫氣,效果會(huì)好些。 列舉一些新人犯的錯(cuò)誤: 1 配膠時(shí)加錯(cuò)試劑; 2 電泳時(shí)未通電或未及時(shí)通電; 3 先上樣后加緩沖液; 4 正負(fù)極搞反; 5 緩沖液沒(méi)加夠,浸沒(méi)不了濃縮膠,電路不通; 6 樣品煮完沒(méi)離心;離心是為了去除不溶性顆粒,不然會(huì)影響電泳。 7 電泳時(shí)未用的上樣孔沒(méi)1X上樣緩沖; 8 電泳過(guò)程中漏液等 ________________________________________ (14)我也說(shuō)一下自己遇到的問(wèn)題 1.膠凝時(shí)放入37度溫箱,誰(shuí)知溫度比設(shè)置的高了一兩度,膠凝后發(fā)現(xiàn)邊緣不平整,所以后來(lái)我一直將溫度調(diào)在34度,沒(méi)出過(guò)問(wèn)題,呵呵 2.配好分離膠后,液面用異丙醇封閉,用槍加異丙醇時(shí)太猛了,使膠邊緣凝聚的不平整。所以以后加異丙醇時(shí)要輕輕的 。 [ Last edited by wanhscn on 2011-9-13 at 16:32 ] |
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| 我不算SDS-PAGE新手,但是已經(jīng)算是7年沒(méi)做了,設(shè)備都改陳換代了,所以重新開始做還是犯了一些錯(cuò)誤,列舉如下:1、配膠之前沒(méi)有把檢驗(yàn)漏水的水倒掉,導(dǎo)致倒完水后想灌膠,膠已經(jīng)凝了,只有再配一次。2、玻璃板用得太久沒(méi)注意,導(dǎo)致漏水;3、第一次封膠用1ml的槍,結(jié)果出現(xiàn)波浪,第二次改用100ul的效果還行,只是100ul感覺(jué)量太少,在網(wǎng)上看見說(shuō)用200ul好,所以決定下次用200ul. |
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