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thestormcong銀蟲 (小有名氣)
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求助16sv3區(qū)結(jié)果分析 已有8人參與
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這是本人的16sv3區(qū)擴(kuò)增產(chǎn)物，模板為16spcr全序列，引物為v3區(qū)通用引物，結(jié)果顯示該區(qū)很寬，是不是有非特異性擴(kuò)增，能否直接進(jìn)行下一步的DGGE，請教各位能夠指點，非常感謝！ |
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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
1949stone(MolEPI+1): 鼓勵 2011-10-07 23:27:25
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
1949stone(MolEPI+1): 鼓勵 2011-10-07 23:27:25
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建議你用QIAGEN的盒子，這個貴點，但是考慮到你對細(xì)菌定量的準(zhǔn)確性這個絕對物有所值！另外你如果16s出來的結(jié)果是單一條帶，那理論上出來的出來的應(yīng)該是單一條帶。但是也不排除多種條帶的可能。你這個多做幾遍試試把。不行的話就整個上膠。不過這個和DGGE的功能優(yōu)勢貌似有點不符~~ 另外說點個人的看法啊，你用基因組擴(kuò)增16S全長，在這個過程中其實原始細(xì)菌的量反應(yīng)在你PCR結(jié)果上應(yīng)該就不準(zhǔn)了，因為通用引物對每種細(xì)菌16S的擴(kuò)增效率是不一樣的，這樣出來的結(jié)果本來就不準(zhǔn)確了，然后你在用這個不準(zhǔn)的結(jié)果再次用DGGE引物擴(kuò)增，這個貌似就更不靠譜了。所以我個人認(rèn)為這樣做欠妥。個人看法，僅供參考哈。 |
6樓2011-10-07 23:13:17
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