 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2054 | 回復(fù): 3 | ||
zhymhbu木蟲 (正式寫手)
|
[求助]
請(qǐng)問(wèn)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹 比對(duì)菌株的選擇原則
|
|
分離得到的菌16S測(cè)序后，用NCBI的blast比對(duì)。99%相似度的就有幾十個(gè)。而且都是同一個(gè)種的菌株。請(qǐng)問(wèn)兩個(gè)問(wèn)題： 1 如果構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹，如何選擇具體菌株進(jìn)行建樹。有人說(shuō)過(guò)查L(zhǎng)PSN。用模式株比對(duì)。是這樣嗎。我看國(guó)內(nèi)微生物學(xué)報(bào)和通報(bào)上也不都是這樣。有什么原則嗎 2 發(fā)育樹的各個(gè)分支，如何選擇。比如我的菌應(yīng)該是地衣芽孢桿菌，那么我建樹是選擇芽孢桿菌屬的相似度高的菌株嗎，還需要選擇其他屬的細(xì)菌建樹嗎 困惑了很久的問(wèn)題，請(qǐng)高手賜教呀 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
0703化學(xué)336分求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
293求調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
281求調(diào)劑（0805）
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
環(huán)境領(lǐng)域全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室招收博士1-2名
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
材料專碩306英一數(shù)二
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
301求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿天津大學(xué)化學(xué)工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
302求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
26博士申請(qǐng)
已經(jīng)有3人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 菜鳥求助——我系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建不出來(lái)——構(gòu)建出來(lái)的怎么是這樣的
已經(jīng)有15人回復(fù)
- 細(xì)菌多樣性，構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹中如何選擇outgroup？急�。。。。。。�
已經(jīng)有15人回復(fù)
- 系統(tǒng)發(fā)育樹如何分析，得出結(jié)論？
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 有沒有誰(shuí)知道如何構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹呀？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 基于氨基酸的系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 建系統(tǒng)發(fā)育樹時(shí)怎么樣才能調(diào)高bootstrap值��？送金幣
已經(jīng)有34人回復(fù)
- MEGA 5.0構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹的問(wèn)題
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 求助：構(gòu)建發(fā)育樹
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 真菌種屬鑒定 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助/交流】（求助）急 回答就送金幣啊關(guān)于mega 和phylip 畫出來(lái)的系統(tǒng)發(fā)育樹
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助/交流】如何構(gòu)建系統(tǒng)更發(fā)育樹
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 【求助/交流】序列人工校正與構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助/交流】關(guān)于系統(tǒng)發(fā)育樹，如何鑒定菌種
已經(jīng)有12人回復(fù)
zhymhbu
木蟲 (正式寫手)
- MicEPI: 1
- 應(yīng)助: 58 (初中生)
- 金幣: 3029.3
- 紅花: 3
- 帖子: 693
- 在線: 131.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 427200
- 注冊(cè): 2007-07-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 化學(xué)環(huán)境污染與健康
2樓2011-10-10 14:20:19
zhen_fang
銀蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 1330.4
- 散金: 28
- 紅花: 2
- 帖子: 447
- 在線: 70.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 1361814
- 注冊(cè): 2011-08-05
- 性別: GG
- 專業(yè): 微生物生理與生物化學(xué)
3樓2011-10-18 18:29:37
david1as
至尊木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 24980.4
- 紅花: 1
- 帖子: 1633
- 在線: 181小時(shí)
- 蟲號(hào): 131450
- 注冊(cè): 2005-12-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 食品科學(xué)基礎(chǔ)
4樓2011-10-20 09:48:26
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 zhymhbu 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +9 | 負(fù)心者當(dāng)誅 2026-03-11 | 9/450 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +6 | 孔志浩 2026-03-12 | 11/550 |
|
|
[考研] 085600材料與化工 +4 | 安全上岸！ 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考博] 26申博 +4 | 八旬速覽 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿南京大學(xué)，080500材料科學(xué)與工程，調(diào)劑 +4 | Jy? 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料專碩274一志愿陜西師范大學(xué)求調(diào)劑 +5 | 薛云鵬 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿985，本科211，0817化學(xué)工程與技術(shù)319求調(diào)劑 +5 | Liwangman 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +4 | ahbd 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0703 物理化學(xué)調(diào)劑 +3 | 我可以上岸的對(duì)?/a> 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研]
 機(jī)械專碩調(diào)劑
+3
|
笨笨兔子 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 中科大材料與化工319求調(diào)劑 +3 | 孟鑫材料 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 330求調(diào)劑 +3 | ?醬給調(diào)劑跪了 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +4 | 快樂(lè)的香蕉 2026-03-11 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +5 | 是Lupa啊 2026-03-11 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 工科，求調(diào)劑 +3 | 我887 2026-03-11 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求b區(qū)學(xué)校調(diào)劑 +3 | 周56 2026-03-11 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿211化學(xué)學(xué)碩310分求調(diào)劑 +8 | 努力奮斗112 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +3 | 是Lupa啊 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0817化學(xué)工程與技術(shù)考研312分調(diào)劑 +3 | T123 tt 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 152697 2026-03-12 | 4/200 |
|