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xiaoyingw金蟲 (小有名氣)
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[求助]
VMD 統(tǒng)計某個分子周圍水分子數(shù)目隨時間的變化
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| 請問大家,VMD 怎么統(tǒng)計某個分子10埃范圍內水分子數(shù)目隨時間的變化? |
編程 | VMD 可視化軟件 |

木蟲 (正式寫手)
獨行者
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試試這個腳本吧: set outfile [open ***.dat w]; set nf [molinfo top get numframes] for { set i 1 } { $i<=$nf } { incr i 1} { set atom [atomselect top "該分子10A以內的水分子"] $atom frame $i $atom update set com [$atom num] puts $outfile "$i $com" } close $outfile |

木蟲 (著名寫手)
金蟲 (小有名氣)

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