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xiaoyingw金蟲 (小有名氣)
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[求助]
VMD 統(tǒng)計(jì)某個(gè)分子周圍水分子數(shù)目隨時(shí)間的變化
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| 請(qǐng)問大家，VMD 怎么統(tǒng)計(jì)某個(gè)分子10埃范圍內(nèi)水分子數(shù)目隨時(shí)間的變化？ |
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9樓2014-09-25 20:09:18
liqingwen
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【答案】應(yīng)助回帖
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御劍江湖(金幣+5): 謝謝 2011-10-18 20:15:17
xiaoyingw(金幣+20): 2011-10-19 11:15:00
御劍江湖(金幣+5): 謝謝 2011-10-18 20:15:17
xiaoyingw(金幣+20): 2011-10-19 11:15:00
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試試這個(gè)腳本吧： set outfile [open ***.dat w]; set nf [molinfo top get numframes] for { set i 1 } { $i<=$nf } { incr i 1} { set atom [atomselect top "該分子10A以內(nèi)的水分子"] $atom frame $i $atom update set com [$atom num] puts $outfile "$i $com" } close $outfile |
2樓2011-10-18 18:10:54
wally8962
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3樓2011-10-19 09:36:46
xiaoyingw
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4樓2011-10-19 11:14:47
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