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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 微生物 » 實驗/技術 » 真菌建樹遇到瓶頸了
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[求助]
真菌建樹遇到瓶頸了
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| 自己摸索建樹，實驗室其他人都不做這個方面，我想在此請教一下大家：真菌建樹時的模式菌株怎么找？最后使用的圖譜是拓撲圖還是建樹時直接計算出來的圖譜？在轉換為ALN格式時還需要將序列不同的部分比較多的菌種進行修改嗎？是不是要將這一部分忽略？希望專家能給我答疑，謝謝~ |
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【答案】應助回帖
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你可以看看你的那個屬的菌在International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology雜志中是否有，因為這個雜志很多是報道新菌的，你可以參考下。你建出來的phylogenetic tree圖一般是用“鄰接法”建樹。 可參照帖子：http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=2990568 |
2樓2011-10-21 15:13:24
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