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分子結(jié)構(gòu)金蟲 (小有名氣)
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[求助]
真菌建樹遇到瓶頸了
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| 自己摸索建樹，實(shí)驗(yàn)室其他人都不做這個(gè)方面，我想在此請教一下大家：真菌建樹時(shí)的模式菌株怎么找？最后使用的圖譜是拓?fù)鋱D還是建樹時(shí)直接計(jì)算出來的圖譜？在轉(zhuǎn)換為ALN格式時(shí)還需要將序列不同的部分比較多的菌種進(jìn)行修改嗎？是不是要將這一部分忽略？希望專家能給我答疑，謝謝~ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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你可以看看你的那個(gè)屬的菌在International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology雜志中是否有，因?yàn)檫@個(gè)雜志很多是報(bào)道新菌的，你可以參考下。你建出來的phylogenetic tree圖一般是用“鄰接法”建樹。 可參照帖子：http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=2990568 |
2樓2011-10-21 15:13:24
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