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zhengting000新蟲 (初入文壇)
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[求助]
NAMD中特殊bond定義問(wèn)題
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我現(xiàn)在有一個(gè)疑問(wèn)： 現(xiàn)在我要定義這樣一種作用形式：體系中有A-B-C排序的原子，A-B B-C 之間只有bond作用，忽略A和B之間以及B和C之間的相互作用而單純靠定義bond作用來(lái)約束距離，A-C之間的相互作用要忽略 在同一個(gè)體系中 我定義D-E-F，同樣D-E之間 E-F之間的相互作用力忽略且單純靠定義的bond作用來(lái)約束，但是，此時(shí)我要求A-C之間的相互作用不能忽略 NAMD能不能實(shí)現(xiàn)這種要求？該怎么定義實(shí)現(xiàn)呢？ 謝謝 |
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chenjung0825
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2樓2012-02-18 18:29:30
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