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wangyan10鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[求助]
分子對接后小分子配體利用AntechAmber構建力場的問題
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想請教一個問題�，F(xiàn)在手中有一個體系，用DS2.5中的Flexible Docking做的分子對接，之后打算用AMBER對這個complex進行分子動力學模擬。小分子配體需要自己利用AntechAmber構建力場。在論壇上面也看到了那個講構建小分子力場的教程。問題來了，構建力場的小分子是要從我那個對接結果的complex中抽取還是可以直接從小分子數(shù)據(jù)庫中提��？自己也試著從對接結果的complex中抽取小分子來按照教程上順序去操作，可是總會遇到各種各樣的問題�，F(xiàn)在想能不能直接down一個我研究的那個小分子配體來直接構建力場？急切盼望高手解答！謝謝各位！ |
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2樓2012-03-14 04:02:52
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