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cfmzxf84木蟲 (正式寫手)
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[求助]
求助，已有PDB結構的DS同源建模步驟，謝謝
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求助，我想用DS同源建模，已有多個PDB模板可以用，請教怎么操作呢？ 網(wǎng)上的教程基本上都是需要n95，或者90數(shù)據(jù)庫，從網(wǎng)上download結構。 我有自己的模版，因此改變了一些步驟來做，但是一直不成功，求指導。謝謝 |
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4樓2012-03-18 08:10:05
【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應助指數(shù) +1
jiaoyixiong: 金幣+3, 鼓勵交流 2012-03-17 19:49:58
cfmzxf84: 金幣+10, ★★★很有幫助, 謝謝 2012-03-18 00:16:03
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cfmzxf84: 金幣+10, ★★★很有幫助, 謝謝 2012-03-18 00:16:03
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首先把你要建模的目標序列編譯成fasta文件 然后打開編好的fasta文件接著打開你要當做模板的pdb文件 接下來在protocol里找到align sequence to template模塊，分別放入你的序列文件和pdb文件，修改相應參數(shù) 計算完成后打開運行結果然后運行build homology modle放入相應的文件進行運算就ok了。 |
2樓2012-03-17 19:43:10
cfmzxf84
木蟲 (正式寫手)
- 應助: 4 (幼兒園)
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- 散金: 822
- 紅花: 1
- 帖子: 908
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- 蟲號: 814536
- 注冊: 2009-07-23
- 專業(yè): 化學環(huán)境污染與健康
3樓2012-03-18 00:17:52
cfmzxf84
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5樓2012-03-18 09:09:40
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