 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1366 | 回復: 1 | |||
astringent銅蟲 (著名寫手)
|
[交流]
求gromacs下QM/MM交作業(yè)pbs腳本 已有1人參與
|
| 最近用gmx和orca做qmmm，想在計算機集群上提交作業(yè)，我自己寫了一個腳本，可是提交之后，根本沒計算。請問大家有沒有用gromcas做QMMMM交作業(yè)的pbs腳本？借鑒一些，不甚感激 |
回復此樓» 猜你喜歡
【考研調劑】化學專業(yè) 281分，一志愿四川大學，誠心求調劑
已經(jīng)有4人回復
-
317求調劑
已經(jīng)有5人回復
-
0817 化學工程 299分求調劑 有科研經(jīng)歷 有二區(qū)文章
已經(jīng)有10人回復
-
一志愿 西北大學 ，070300化學學碩，總分287，雙非一本，求調劑。
已經(jīng)有3人回復
-
一志愿福大288有機化學，求調劑
已經(jīng)有3人回復
-
085600材料與化工求調劑
已經(jīng)有6人回復
-
一志愿西安交通大學材料工程專業(yè) 282分求調劑
已經(jīng)有6人回復
-
085600材料與化工調劑 324分
已經(jīng)有10人回復
-
294求調劑材料與化工專碩
已經(jīng)有11人回復
-
一志愿南昌大學，327分，材料與化工085600
已經(jīng)有3人回復
» 本主題相關價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 求Gromacs中Glycam力場數(shù)據(jù)包。。非常感謝
已經(jīng)有5人回復
- 如何編寫PBS作業(yè)的腳本？
已經(jīng)有14人回復
- [新手求教]安裝Gromacs后，查看pdb2gmx命令，顯示無此命令
已經(jīng)有9人回復
- 【求助】這是我安裝gromacs過程，但是出錯阿，這個怎么辦呢？謝謝
已經(jīng)有11人回復
- 【求助】GROMACS分析二面角隨時間的變化
已經(jīng)有4人回復
- 【求助】gromacs出現(xiàn)了一個問題
已經(jīng)有10人回復
- 【求助】求一個gromacs的中文教程，包括安裝的部分，小弟新手，從零學起
已經(jīng)有8人回復
- 【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多嗎？如何選擇？
已經(jīng)有7人回復
- 【求助】求GROMACS模擬表面活性劑在油水表面的行為的例子
已經(jīng)有7人回復
★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
|
你可以看看能前臺運行嗎（不用腳本提交） 看看是你提交命令的腳本錯了 還是PBS的腳本錯了 這有一個普通的GROMACS的PBS腳本 #!/bin/bash #PBS -N simg-gmx-test #PBS -l nodes=1:beta:ppn=24 #PBS -q simg_queue #PBS -j oe nprocs=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l` cd $PBS_O_WORKDIR #========setup environment======== export GMXLIB=/public/home/simg/software/gromacs_v4/share/top #========prepare parameters for lam mpi======== uniq $PBS_NODEFILE > lamnodes recon -v lamnodes lamboot -v lamnodes rm -f lamnodes #========runing script========== grompp_mpi_v4 -f em.mdp -c com.gro -n index.ndx -p com.top -o em.tpr mdrun_mpi_v4 -s em.tpr -o em.trr -x em.xtc -c b4md.gro -tableb table.xvg -tablep tablep.xvg -table table.xvg -v grompp_mpi_v4 -f md.mdp -c b4md.gro -n index.ndx -p com.top -o md.tpr mpirun -np $nprocs mdrun_mpi_v4 -s md.tpr -o md.trr -x md.xtc -c aft_md.gro -tableb table.xvg -tablep tablep.xvg -table table.xvg -v > log |
2樓2012-04-02 18:53:29
相關版塊跳轉
我要訂閱樓主 astringent 的主題更新
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 【考研調劑】化學專業(yè) 281分，一志愿四川大學，誠心求調劑 +4 | 吃吃吃才有意義 2026-03-19 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 317求調劑 +3 | 申子申申 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學 ，070300化學學碩，總分287，雙非一本，求調劑。 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉林大學材料學碩321求調劑 +6 | Ymlll 2026-03-18 | 9/450 |
|
|
[考研] 274求調劑 +6 | S.H1 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 311求調劑 +4 | 冬十三 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 344求調劑 +6 | knight344 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 化學工程321分求調劑 +15 | 大米飯！ 2026-03-15 | 18/900 |
|
|
|
[考研] 298-一志愿中國農(nóng)業(yè)大學-求調劑 +7 | 手機用戶 2026-03-17 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 304求調劑 +12 | 小熊joy 2026-03-14 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 299求調劑 +5 | △小透明* 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 301求調劑 +9 | yy要上岸呀 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 268求調劑 +8 | 一定有學上- 2026-03-14 | 9/450 |
|
|
|
[碩博家園] 湖北工業(yè)大學 生命科學與健康學院-課題組招收2026級食品/生物方向碩士 +3 | 1喜春8 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料專碩326求調劑 +6 | 墨煜姒莘 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料工程專碩274一志愿211求調劑 +6 | 薛云鵬 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿南京大學，080500材料科學與工程，調劑 +4 | Jy? 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 327求調劑 +6 | 拾光任染 2026-03-15 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 0856專碩279求調劑 +5 | 加油加油！? 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 081200-11408-276學碩求調劑 +3 | 崔wj 2026-03-12 | 4/200 |
|