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weandyouzhy木蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
PCR的引物擴(kuò)增后會(huì)被降解掉嗎?
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一般的DNA復(fù)制完成時(shí),RNA引物會(huì)被降解掉。那么在pcr擴(kuò)增反應(yīng)中。Taq酶會(huì)不會(huì)將引物鏈剪切掉呢?另外,能不能詳細(xì)的介紹下PCR中所加試劑的量的原因。謝謝了 |
【分子生物】EPI帖 |

木蟲(chóng) (小有名氣)
鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

木蟲(chóng) (小有名氣)
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應(yīng)該是不會(huì)的,因?yàn)樵谀闩苣z的時(shí)候會(huì)發(fā)現(xiàn)在最頂端還是有引物條帶存在的,而且Taq酶均具有5'-3'聚合酶活性,但不一定具有3'-5'和5'-3'的外切酶活性。3'-5'外切酶活性可以消除錯(cuò)配,切平末端;5'-3'外切酶活性可以消除合成障礙。 PCR試劑中的量: 1.首先要看你的體系是多少ul,規(guī)劃好引物、模板、dNTP、酶和Buffer的量,其余用水補(bǔ)齊。 2.引物一般是要過(guò)量的,這樣才能保證PCR能夠在設(shè)定的循環(huán)里面跑完,一般濃度是uM。 3.模板一般就是ng級(jí)別的就可以了,主要是能保證前期引物可以與其結(jié)合。 4.dNTP的話一般都是mM級(jí)別的,它的濃度要比較大,保證反應(yīng)順利進(jìn)行。 5.酶的話說(shuō)明書(shū)上一般都會(huì)提到,按它的活性和單位來(lái)加就可以了。 6.Buffer要根據(jù)你的總體積,將儲(chǔ)備濃度換算成最終的1X的就可以了。 祝好運(yùn)! |
至尊木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
| 答案是否定的,Taq酶不具有水解引物的能力,不然的話PCR還如何繼續(xù),或者是你如何控制Taq酶發(fā)揮作用?PCR條件中有考慮這方面的嗎?此外,在拿PCR產(chǎn)物跑膠時(shí),有時(shí)能看到明顯的引物二聚體條帶,這也說(shuō)明引物不會(huì)被降解。PCR體系中各組分的量基本是圍繞酶和模板確定的,Buffer是10×的,當(dāng)然加總體積的十分之一了,Mg離子的濃度關(guān)系到Taq酶的活力也是確定的,引物的濃度只要達(dá)到一定程度就好了,過(guò)多會(huì)產(chǎn)生二聚體之類的,過(guò)少影響PCR反應(yīng)啟動(dòng),模板也是的,多了也不好純化啊,酶的話一般都有推薦量的,一定的體積加上那么多的酶就能滿足要求了。而且酶的說(shuō)明書(shū)也沒(méi)有明確說(shuō)其活力如何,只是給出在一定條件下的PCR結(jié)果罷了,只是參考。 |

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