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zdz103979358新蟲 (初入文壇)
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[求助]
如何用分子力學(xué)方法模擬
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本人初學(xué)MS，用分子力學(xué)方法研究緩蝕劑分子在金屬表面的自組裝成膜機制。緩蝕劑分子在Fe（001）表面的覆蓋度為0.64n㎡/個，即咪唑啉在Fe（001）表面達到飽和吸附。模擬體系大小為3.24nm×2.24nm×6.03nm，包含16個咪唑啉緩蝕劑分子。 上述該如何構(gòu)建。本人軟件操作不熟，最好每一步驟寫越詳細越好。萬分感謝。 |
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+3, 謝謝~ 2012-04-14 20:50:01
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+3, 謝謝~ 2012-04-14 20:50:01
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我也在做這方面的工作，但是沒人指點，一個人根據(jù)文獻，根據(jù)教程在做。很希望懂的人能給出好的建議，雖然樓上說的沒錯，但還是希望樓主多分包容，別人不懂，尤其是沒學(xué)過量子化學(xué)，計算化學(xué)的同學(xué)，他們的要求只是想知道軟件的操作，來做個簡單的模擬，二樓沒必要這么鄙視我們這種菜鳥。大家都是從菜鳥過來的。 再回到正題，樓主的問題，可以參考文獻，軟件的操作步驟可以參考教程中有關(guān) 內(nèi)容： 構(gòu)建結(jié)構(gòu)：使用Build | Crystal 切表面 ： Build | Surface ——>cleave surface 結(jié)構(gòu)優(yōu)化，幾何優(yōu)化，可以用Discover 另外還涉及到建盒子的問題： 用Amorphous Cell 至于怎么操作，看教程吧，涉及到的步驟太多了 |
3樓2012-04-14 12:39:34
shengxiang
木蟲 (著名寫手)
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