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xiazhiwuxie銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
大片段連接問(wèn)題
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實(shí)驗(yàn)室得到一個(gè)片段為2300bp左右的DNA序列,但是連接了半個(gè)月都沒(méi)有連上,連接體系是:19T 0.5ul 目的條帶 5ul solution I 5ul 過(guò)夜4度,16度連接3h 也做過(guò)16度連接兩夜 做過(guò)4度 期間確定目的條帶回收正確,連接體系也用了最新的,感受態(tài)是買的,在這個(gè)條帶的靠近3‘端約200bp是已知的,根據(jù)這個(gè)片段設(shè)計(jì)引物,擴(kuò)增約為140bp。 得到的結(jié)果:1.不長(zhǎng)菌 2.長(zhǎng)菌,但是擴(kuò)增無(wú)條帶 3.長(zhǎng)菌,擴(kuò)增出140bp,但是測(cè)序后,結(jié)果告知插入片段只有200bp,且這200bp片段就是已知部分,抽了質(zhì)粒后得知條帶大約就是比2000bp的大點(diǎn)。 我快瘋了,折騰了半個(gè)月,序列還沒(méi)得到,求高人指導(dǎo)! |
銀蟲 (小有名氣)
金蟲 (正式寫手)

禁蟲 (正式寫手)
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1.連接體系為10uL,目的DNA片段應(yīng)為4.5uL,一般試劑盒都可用,連接溫度是不關(guān)鍵因素,時(shí)間過(guò)夜即可。 2.一定要保證PCR要達(dá)到一定濃度和純度才可以,這一點(diǎn)至關(guān)重要。 3.另外,樓主說(shuō)的300bp引物是菌液PCR檢測(cè)引物嗎?最好用一個(gè)載體引物,一個(gè)片段上的引物,假陽(yáng)性會(huì)降低,而且最好把全長(zhǎng)擴(kuò)出來(lái)。 4.若果菌液PCR擴(kuò)出來(lái)了就不用提質(zhì)粒了酶切了,可以直接測(cè)序。 |

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