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liulinlinyan銅蟲 (正式寫手)
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[交流]
gromacs 蛋白質(zhì)自組裝 已有1人參與
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請教各位高手，gromacs中是否可以實現(xiàn)蛋白質(zhì)的靜電自組裝，能否推薦一下相關(guān)的教程或者參考之類的；還有就是MARTINI力場能否實現(xiàn)對于蛋白質(zhì)自組裝的模擬研究，我看官網(wǎng)上說起不能進(jìn)行蛋白質(zhì)折疊的研究，那么蛋白質(zhì)的折疊與蛋白質(zhì)的自組裝之間具有怎樣的差別呢，另外對于NAMD和gromacs，哪一個對于模擬較好呢？首先先感謝各位的積極參與討論以及指點！ [ Last edited by liulinlinyan on 2012-4-15 at 19:14 ] |
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zh1987hs: 金幣+2, 謝謝 2012-04-18 19:38:52
| MARTINI力場由于在力場參數(shù)中需要確定蛋白的二級結(jié)構(gòu)，所以不能用來研究蛋白質(zhì)折疊的研究。對于軟件NAMD和gromacs應(yīng)該都差不多，不過上手本人覺得gromacs很快。 |
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liulinlinyan2樓2012-04-18 19:03:25
liulinlinyan
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