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liulinlinyan銅蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[交流]
gromacs 蛋白質(zhì)自組裝 已有1人參與
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請(qǐng)教各位高手，gromacs中是否可以實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的靜電自組裝，能否推薦一下相關(guān)的教程或者參考之類(lèi)的；還有就是MARTINI力場(chǎng)能否實(shí)現(xiàn)對(duì)于蛋白質(zhì)自組裝的模擬研究，我看官網(wǎng)上說(shuō)起不能進(jìn)行蛋白質(zhì)折疊的研究，那么蛋白質(zhì)的折疊與蛋白質(zhì)的自組裝之間具有怎樣的差別呢，另外對(duì)于NAMD和gromacs，哪一個(gè)對(duì)于模擬較好呢？首先先感謝各位的積極參與討論以及指點(diǎn)！ [ Last edited by liulinlinyan on 2012-4-15 at 19:14 ] |
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小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
zh1987hs: 金幣+2, 謝謝 2012-04-18 19:38:52
小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
zh1987hs: 金幣+2, 謝謝 2012-04-18 19:38:52
| MARTINI力場(chǎng)由于在力場(chǎng)參數(shù)中需要確定蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)，所以不能用來(lái)研究蛋白質(zhì)折疊的研究。對(duì)于軟件NAMD和gromacs應(yīng)該都差不多，不過(guò)上手本人覺(jué)得gromacs很快。 |
liulinlinyan2樓2012-04-18 19:03:25
liulinlinyan
銅蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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3樓2012-04-20 16:38:59
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