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c03185新蟲 (小有名氣)
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VASP并行計(jì)算時(shí)，提示“超過CPU時(shí)限”而退出計(jì)算。請問如何解決？
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running on 8 nodes distr: one band on 1 nodes, 8 groups vasp.5.2.2 15Apr09 complex POSCAR found : 2 types and 6 ions LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected FFT: planning ...( 1 ) reading WAVECAR entering main loop N E dE d eps ncg rms rms(c) RMM: 1 0.112962560756E+03 0.11296E+03 -0.69848E+03 1512 0.693E+02 RMM: 2 -0.305217733500E+01 -0.11601E+03 -0.12362E+03 1512 0.173E+02 RMM: 3 -0.220863257631E+02 -0.19034E+02 -0.16605E+02 1512 0.684E+01 RMM: 4 -0.266524934524E+02 -0.45662E+01 -0.26797E+01 1512 0.403E+01 RMM: 5 -0.274449693522E+02 -0.79248E+00 -0.70905E+00 1512 0.164E+01 RMM: 6 -0.276538353951E+02 -0.20887E+00 -0.18463E+00 1512 0.103E+01 RMM: 7 -0.277119302964E+02 -0.58095E-01 -0.54192E-01 1512 0.446E+00 RMM: 8 -0.277288405566E+02 -0.16910E-01 -0.15880E-01 1512 0.291E+00 RMM: 9 -0.277355360489E+02 -0.66955E-02 -0.65108E-02 3234 0.128E+00 RMM: 10 -0.277360809052E+02 -0.54486E-03 -0.54143E-03 3277 0.298E-01 RMM: 11 -0.277361101359E+02 -0.29231E-04 -0.27153E-04 2774 0.783E-02 RMM: 12 -0.277361131135E+02 -0.29776E-05 -0.30028E-05 2469 0.192E-02 0.196E+01 RMM: 13 -0.341632543219E+02 -0.64271E+01 -0.12383E+02 3090 0.946E+01 0.154E+01 RMM: 14 -0.236566564684E+02 0.10507E+02 -0.25548E+01 3024 0.434E+01 0.372E+00 RMM: 15 -0.238848699589E+02 -0.22821E+00 -0.90307E+00 3024 0.222E+01 0.667E+00 -------------------------------------------------------------------------- mpirun noticed that process rank 4 with PID 29130 on node login1 exited on signal 24 (CPU time limit exceeded). -------------------------------------------------------------------------- |
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應(yīng)該是類似于bsub的吧，你登入系統(tǒng)的時(shí)候會(huì)有提示的，你注意看下，我們這用的是bsub作業(yè)管理系統(tǒng)，提交作業(yè)的命令式bsub -q long（作業(yè)對列，有normal long等） -n 8（作業(yè)使用的核數(shù)，是你節(jié)點(diǎn)上單棵cpu上核的個(gè)數(shù)的倍數(shù)最好） ./<你的vasp的路徑>vasp，我習(xí)慣將在我的用戶目錄下建一個(gè)bin文件夾，然后將vasp拷到這個(gè)文件夾里，然后設(shè)置環(huán)境變量vi ./bashrc，加入export PATH=$PATH：~/bin/。然后./ |
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