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javy金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[交流]
交流]用multiwfn分析軌道組成的時(shí)候碰到的問(wèn)題 已有2人參與
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大家好，在學(xué)習(xí)multiwfn的過(guò)程中，碰到的一些問(wèn)題（使用的是2.3.3 windows版本的），要麻煩各位了。 1. 主要是想使用SCPA方法分析某個(gè)分子軌道中某分子碎片(比如原子2-10)的組成比例 進(jìn)入主菜單,選擇" 8 Orbital composition analysis"后,定義了所要研究的分子碎片 ,但是只有這個(gè)選項(xiàng)" 6 Print frag. 1 compositions in all orbitals (SCPA)"來(lái)完成我要研究的問(wèn)題,因?yàn)槲业倪@個(gè)分子中有1000多個(gè)分子軌道,這樣輸出的話很耗時(shí)間. 如果選擇的是" 3 Orbital composition analysis with Ros-Schuit (SCPA) partition",雖然可以對(duì)某個(gè)分子軌道進(jìn)行選擇,但是輸出的是基函數(shù),殼層和原子軌道在這個(gè)分子軌道中的貢獻(xiàn),也就是說(shuō),之前定義的分子碎片(比如原子2-10)在這里沒(méi)有作用了. 難道只能自己把數(shù)據(jù)拷出來(lái),加和所研究的分子碎片中對(duì)應(yīng)的原子的貢獻(xiàn)么? 好象說(shuō)的羅嗦了點(diǎn)，這個(gè)問(wèn)題其實(shí)就是Sample Text謝謝 2. 在使用NAO方法分析某個(gè)分子軌道中某分子碎片的組成比例.使用該方法雖然可以通過(guò)" 1 Show fragment contribution in a range of orbitals"得到某一指定范圍內(nèi)的分子軌道中某一分子碎片的組成比例.但是在指定分子碎片的時(shí)候,沒(méi)辦法指定一個(gè)范圍內(nèi)的原子(比如,我想把原子2-50這49個(gè)原子定義為我所要研究的分子碎片),難道只能通過(guò)"a 2,3,4,5,6,7,8..."這樣來(lái)逐個(gè)寫(xiě)入么? 而在用scpa方法的時(shí)候可以通過(guò)"cond"來(lái)指定范圍.這個(gè)問(wèn)題就是想知道Sample Text 3. 還有想知道,當(dāng)退出multiwfn界面的時(shí)候,閃過(guò)的那幾行"unknown ..."什么的,具體是什么啊?閃太快了，沒(méi)看清楚,還是就我這邊會(huì)碰到這個(gè)問(wèn)題?大家有碰到么?因?yàn)槲?u>Sample Text~ 主要我是在用NAO分析時(shí)候,輸入文件是用gaussian計(jì)算的(有NAO軌道系數(shù)),確定加了"pop=nboread"和"$NBO NAOMO $END",只不過(guò)所研究的體系含有重元素,采用了贗勢(shì)基組，不知道是否有影響. 謝謝~ 謝謝大家~ |
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javy
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2樓2012-05-02 23:29:39
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gmy1990: 金幣+5 2012-05-03 14:48:02
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gmy1990: 金幣+5 2012-05-03 14:48:02
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1 大量數(shù)據(jù)在屏幕上輸出是需要一些時(shí)間，可以使用重定向方法將結(jié)果輸出到文件里，這樣輸出速度就會(huì)很快，見(jiàn)手冊(cè)5.2。另外，Linux版本的命令行窗口輸出速度比windows的快得多，有條件的話用Linux版本也行。 在即將發(fā)布的2.4版中，我會(huì)讓選項(xiàng)1~3的輸出信息的末尾也輸出自定義片段的總成分。 2 在2.4版中NAO方法將可以用比如a 2-50這種輸入方法把2~50號(hào)原子都加入片段中。 3 用戶直接退出時(shí)出現(xiàn)的unknown之類(lèi)的信息是編譯器的調(diào)試信息，用戶不必理會(huì)它。用贗勢(shì)沒(méi)關(guān)系。 2.4版將在最近幾天內(nèi)發(fā)布，請(qǐng)關(guān)注multiwfn網(wǎng)站。 |
3樓2012-05-03 14:04:59
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4樓2012-05-03 15:14:41
javy
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5樓2012-05-03 15:20:14
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