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javy金蟲 (正式寫手)
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[交流]
交流]用multiwfn分析軌道組成的時候碰到的問題 已有2人參與
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大家好，在學習multiwfn的過程中，碰到的一些問題（使用的是2.3.3 windows版本的），要麻煩各位了。 1. 主要是想使用SCPA方法分析某個分子軌道中某分子碎片(比如原子2-10)的組成比例 進入主菜單,選擇" 8 Orbital composition analysis"后,定義了所要研究的分子碎片 ,但是只有這個選項" 6 Print frag. 1 compositions in all orbitals (SCPA)"來完成我要研究的問題,因為我的這個分子中有1000多個分子軌道,這樣輸出的話很耗時間. 如果選擇的是" 3 Orbital composition analysis with Ros-Schuit (SCPA) partition",雖然可以對某個分子軌道進行選擇,但是輸出的是基函數(shù),殼層和原子軌道在這個分子軌道中的貢獻,也就是說,之前定義的分子碎片(比如原子2-10)在這里沒有作用了. 難道只能自己把數(shù)據(jù)拷出來,加和所研究的分子碎片中對應的原子的貢獻么? 好象說的羅嗦了點，這個問題其實就是Sample Text謝謝 2. 在使用NAO方法分析某個分子軌道中某分子碎片的組成比例.使用該方法雖然可以通過" 1 Show fragment contribution in a range of orbitals"得到某一指定范圍內(nèi)的分子軌道中某一分子碎片的組成比例.但是在指定分子碎片的時候,沒辦法指定一個范圍內(nèi)的原子(比如,我想把原子2-50這49個原子定義為我所要研究的分子碎片),難道只能通過"a 2,3,4,5,6,7,8..."這樣來逐個寫入么? 而在用scpa方法的時候可以通過"cond"來指定范圍.這個問題就是想知道Sample Text 3. 還有想知道,當退出multiwfn界面的時候,閃過的那幾行"unknown ..."什么的,具體是什么啊?閃太快了，沒看清楚,還是就我這邊會碰到這個問題?大家有碰到么?因為我Sample Text~ 主要我是在用NAO分析時候,輸入文件是用gaussian計算的(有NAO軌道系數(shù)),確定加了"pop=nboread"和"$NBO NAOMO $END",只不過所研究的體系含有重元素,采用了贗勢基組，不知道是否有影響. 謝謝~ 謝謝大家~ |
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sobereva
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gmy1990: 金幣+5 2012-05-03 14:48:02
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
gmy1990: 金幣+5 2012-05-03 14:48:02
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1 大量數(shù)據(jù)在屏幕上輸出是需要一些時間，可以使用重定向方法將結(jié)果輸出到文件里，這樣輸出速度就會很快，見手冊5.2。另外，Linux版本的命令行窗口輸出速度比windows的快得多，有條件的話用Linux版本也行。 在即將發(fā)布的2.4版中，我會讓選項1~3的輸出信息的末尾也輸出自定義片段的總成分。 2 在2.4版中NAO方法將可以用比如a 2-50這種輸入方法把2~50號原子都加入片段中。 3 用戶直接退出時出現(xiàn)的unknown之類的信息是編譯器的調(diào)試信息，用戶不必理會它。用贗勢沒關(guān)系。 2.4版將在最近幾天內(nèi)發(fā)布，請關(guān)注multiwfn網(wǎng)站。 |
3樓2012-05-03 14:04:59
javy
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5樓2012-05-03 15:20:14
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