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濤濤不絕1988新蟲 (初入文壇)
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[求助]
魚類線粒體DNA的提取 已有1人參與
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我最近在做魚類線粒體DNA的提取,用的常規(guī)的堿裂解法提取的,提了7、8次了,但是跑完膠之后除了Maker什么也沒有,急啊~ 求高手幫忙分析一下,謝了! (具體步驟:1、取動物組織2-8g,用SE緩沖夜漂洗,剪碎,加入約30mlSE緩沖液,0℃勻漿,1500rpm 10min,取上清 12000rpm 15min,沉淀物為線粒體,用STM溶液洗一遍。 2、以溶液體積與組織重量0.2ml:1g的STM溶液懸浮線粒體,加DNaseA溶液,(終濃度達到100ug/ml)30℃水浴30min,加EDTA溶液(至終濃度10mmol/L)搖勻,10000rpm 10min,沉淀即線粒體。 3、取部分線粒體用Janus Green B染色并觀察線粒體的數(shù)目、大小。 4、剩余的線粒體用SE緩沖液洗一遍,然后用4mlSE溶液懸浮純凈線粒體,均分于4支EP管中。 5、12000rpm 10min;棄上清液,每管加150ulTEN溶液,懸浮沉淀,各加入300ul新配制的溶液Ⅴ,混合均勻,冰浴10min;再各加入225ul冷的KAc溶液,冰浴30min。 6、12000rpm 10min,取上清液; 加人與上清液等體積的飽和酚, 輕搖15min; 12000rpm 10min,取上清液; 加人與上清液等體積的氯仿-異戊醇(24 : 1 ) ,充分混合均勻,輕搖15min。12000rpm 10min, 吸取水相。 7、加入1/10體積的3mol/L、PH5.2的醋酸鈉,再加入兩倍體積無水乙醇,冰浴30min,12000rpm 10min,加入冷的(0℃)70%乙醇溶液洗一次,12000rpm 2min。自然干燥3-4 h或4℃ 冰箱中過夜徹底干燥;加入適量TE完全溶解。 8、加入DNase-free的RNaseA溶液(終濃度200ul/ml),37℃消化60min。重復(fù)步驟6和7。 9、取一部分溶液檢測mtDNA的純度和濃度,其余-20℃?zhèn)溆谩#? |

新蟲 (正式寫手)
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問題可能在于DNAse。抽提過程中線粒體膜破裂,DNase把mtDNA給降解了。線粒體其實不是教科書所說的一粒一粒的,而是空間網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),抽提時就有可能線粒體膜破裂了。 能否不用DNase?染色體的DNA很長很大而且結(jié)合很多組蛋白,溫和裂解細胞后很容易被離心沉淀下來的,而線粒體DNA小的多。所以用常用的RNA抽提辦法,就可以抽提出RNA和mtDNA,然后用RNAase降解RNA,剩下的就是mtDNA。 |
銅蟲 (小有名氣)
新蟲 (初入文壇)

銅蟲 (小有名氣)
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