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ITS1和ITS4做樣品體系中真菌菌株鑒定,為啥PCR產(chǎn)物竟然是2個條帶?
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RT,對土壤樣品中的真菌菌株鑒定,除了已知某菌株PCR為單一明亮條帶外,其他土壤樣品的DNA提取物用ITS1和ITS4這對引物擴增在500-700bp大都有2個目標條帶。。。。什么情況? 這樣的PCR產(chǎn)物能夠拿去克隆測序嗎? 將500-700bp的兩個條帶都切膠回收,可以克隆測序嗎?請高手指點。 |
土壤真菌 | 土壤真菌 |
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1.不同真菌的ITS片段大小是不一樣的,大小在500-750bp之間,個別在1000左右 2.土壤樣品的DNA提取物用ITS1和ITS4這對引物擴增在500-750bp大都有2個目標條帶是正常的,因為土壤中的真菌種類很多,所以條帶會多,而且普通電泳無法區(qū)分,所以用切膠回收做克隆測序的話,也會得到很多真菌,而不是單一的,我覺得做克隆測序是可以的 |
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