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ts2009木蟲 (著名寫手)
無業(yè)游民
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[求助]
哪位大俠知道求蛋白質(zhì)中兩兩殘基之間的距離的軟件或是NAMD的腳本可供使用，不勝感激
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所有的距離都要算，例如一共10個殘基，1-2,1-3.。。。所有兩個殘基之間的距離，望高手指點~~~ [ 來自科研家族 生物醫(yī)藥家族 ] [ Last edited by ts2009 on 2012-5-28 at 20:28 ] |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+3, 謝謝~ 2012-05-29 09:14:08
ts2009: 金幣+20, ★★★很有幫助 2012-05-29 09:24:42
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ts2009: 金幣+20, ★★★很有幫助 2012-05-29 09:24:42
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這個簡單使用gromacs中的g_mindist或者g_dist 自己去看看手冊這兩個命令的區(qū)別 要是兩兩殘基之間的距離，我推薦使用g_mindist 把每個殘基單獨定義一個group就很容易算了。 要是NAMD 的話，自己去寫個tcl腳本也可以實現(xiàn) [ Last edited by jiaoyixiong on 2012-5-28 at 21:14 ] |
2樓2012-05-28 21:13:27
mlanqiang
木蟲之王 (文學(xué)泰斗)
藍博士
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3樓2012-05-28 21:48:51
4樓2012-05-28 23:08:30
5樓2012-05-28 23:34:06
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