 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 756 | 回復(fù): 4 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
ts2009木蟲 (著名寫手)
無業(yè)游民
|
[求助]
哪位大俠知道求蛋白質(zhì)中兩兩殘基之間的距離的軟件或是NAMD的腳本可供使用，不勝感激
|
|
|
所有的距離都要算，例如一共10個殘基，1-2,1-3.。。。所有兩個殘基之間的距離，望高手指點~~~ [ 來自科研家族 生物醫(yī)藥家族 ] [ Last edited by ts2009 on 2012-5-28 at 20:28 ] |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
085701環(huán)境工程，267求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
320分，材料與化工專業(yè)，求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
085701環(huán)境工程求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
295材料工程專碩求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
265求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
322求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
085602 307分 求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
0856，材料與化工321分求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
0703化學(xué)求調(diào)劑，各位老師看看我！��！
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
266分，求材料冶金能源化工等調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 下載了MATLAB2012可是安裝不了。大俠幫幫忙謝謝
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 哪位高手能幫忙解釋一下這張DSC圖譜？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- XRD中如何計算殘余奧氏體的量？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 在用fluent做仿真模擬時，連續(xù)性和哪些因素有關(guān)？謝謝各位大俠
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 各位大俠，最近有什么好一點通信類的的EI會議？
已經(jīng)有18人回復(fù)
- 蛋白質(zhì)的鑒定！
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 請教各位大俠我這個情況是哪里的問題（如圖）
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 急求翻譯摘要呀，哪位大俠幫幫忙，感激萬分，應(yīng)助后可追加50金幣
已經(jīng)有2人回復(fù)
- 面試：需試講食品安全方面的課件8分鐘，請各位大俠幫幫忙有沒有這方面的資源，謝謝了
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 各位大俠：《山東大學(xué)學(xué)報》《計算機工程與應(yīng)用》《微電子學(xué)與計算機》哪個比較好？
已經(jīng)有17人回復(fù)
- 請教高手，要用凝固的豬血做蛋白質(zhì)電泳，怎么提取蛋白質(zhì)？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 投稿期刊建議！請各位大俠給些意見
已經(jīng)有25人回復(fù)
- 國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心（上海）（籌）招聘啟事
已經(jīng)有3人回復(fù)
- Ebook__《蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測》中文版
已經(jīng)有124人回復(fù)
- 【專家會診】bay 討論namd,gmx處理水溶液,蛋白等MD 模擬;討論水及水通道
已經(jīng)有50人回復(fù)
5樓2012-05-28 23:34:06
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+3, 謝謝~ 2012-05-29 09:14:08
ts2009: 金幣+20, ★★★很有幫助 2012-05-29 09:24:42
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+3, 謝謝~ 2012-05-29 09:14:08
ts2009: 金幣+20, ★★★很有幫助 2012-05-29 09:24:42
|
這個簡單使用gromacs中的g_mindist或者g_dist 自己去看看手冊這兩個命令的區(qū)別 要是兩兩殘基之間的距離，我推薦使用g_mindist 把每個殘基單獨定義一個group就很容易算了。 要是NAMD 的話，自己去寫個tcl腳本也可以實現(xiàn) [ Last edited by jiaoyixiong on 2012-5-28 at 21:14 ] |
2樓2012-05-28 21:13:27
mlanqiang
木蟲之王 (文學(xué)泰斗)
藍博士
- 應(yīng)助: 3409 (副教授)
- 金幣: 55278.8
- 散金: 5498
- 紅花: 62
- 帖子: 73916
- 在線: 730.8小時
- 蟲號: 302202
- 注冊: 2006-12-02
- 性別: GG
- 專業(yè): 膠體與界面化學(xué)
3樓2012-05-28 21:48:51
4樓2012-05-28 23:08:30
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 322求調(diào)劑 +4 | 宋明欣 2026-03-27 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0856，材料與化工321分求調(diào)劑 +6 | 大饞小子 2026-03-27 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 安徽大學(xué)專碩生物與醫(yī)藥專業(yè)(086000)324分，英語已過四六級，六級521，求調(diào)劑 +4 | 美味可樂雞翅 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工306 +10 | z1z2z3879 2026-03-21 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 334求調(diào)劑 +3 | 雨清天晴 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +10 | Micky11223 2026-03-25 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +7 | 87639 2026-03-21 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +13 | Faune 2026-03-21 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 總分322求生物學(xué)/生化與分子/生物信息學(xué)相關(guān)調(diào)劑 +5 | 星沉uu 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué)學(xué)碩，一志愿湖南大學(xué)，初試成績338 +4 | YYYYYNNNNN 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +6 | 田洪有 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +4 | 15188958825 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 289材料與化工（085600）B區(qū)求調(diào)劑 +4 | 這么名字咋樣 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 340求調(diào)劑 +5 | 話梅糖111 2026-03-24 | 5/250 |
|
|
|
[有機交流]
 有機合成求助
 20+3
|
FENGSHUJEI 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考博] 26申博自薦 +3 | whh869393 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 276求調(diào)劑 +3 | YNRYG 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 一志愿070300浙大化學(xué)358分，求調(diào)劑！
+4
|
酥酥魚.. 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +3 | 濤濤Wjt 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料與化工（0856）304求 B區(qū) 調(diào)劑 +3 | 邱gl 2026-03-21 | 3/150 |
|