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ts2009木蟲 (著名寫手)
無業(yè)游民
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[求助]
哪位大俠知道求蛋白質(zhì)中兩兩殘基之間的距離的軟件或是NAMD的腳本可供使用，不勝感激
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所有的距離都要算，例如一共10個(gè)殘基，1-2,1-3.。。。所有兩個(gè)殘基之間的距離，望高手指點(diǎn)~~~ [ 來自科研家族 生物醫(yī)藥家族 ] [ Last edited by ts2009 on 2012-5-28 at 20:28 ] |
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mlanqiang
木蟲之王 (文學(xué)泰斗)
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3樓2012-05-28 21:48:51
【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+3, 謝謝~ 2012-05-29 09:14:08
ts2009: 金幣+20, ★★★很有幫助 2012-05-29 09:24:42
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ts2009: 金幣+20, ★★★很有幫助 2012-05-29 09:24:42
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這個(gè)簡(jiǎn)單使用gromacs中的g_mindist或者g_dist 自己去看看手冊(cè)這兩個(gè)命令的區(qū)別 要是兩兩殘基之間的距離，我推薦使用g_mindist 把每個(gè)殘基單獨(dú)定義一個(gè)group就很容易算了。 要是NAMD 的話，自己去寫個(gè)tcl腳本也可以實(shí)現(xiàn) [ Last edited by jiaoyixiong on 2012-5-28 at 21:14 ] |
2樓2012-05-28 21:13:27
nic0
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4樓2012-05-28 23:08:30
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5樓2012-05-28 23:34:06
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