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雪靈新蟲 (初入文壇)
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[求助]
CPMD跑動力學(xué)
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我用CPMD跑動力學(xué)模擬，跑了一段時間后作業(yè)掉下來了，向各位請教，怎樣可以讓作業(yè)接著上次的接著算，應(yīng)該在輸入文件中作何改動？謝謝 |
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ChemiAndy
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zh1987hs: 金幣+5, 模擬EPI+1, 鼓勵應(yīng)助！ 2012-05-31 08:08:43
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簡單說，在&CPMD部分第一行寫入 RESTART ALL然后重新提交， CPMD會從RESTART.1文件中讀入上次寫入的原子坐標(biāo)，軌道等信息繼續(xù)算。但是有個前提，就是你前面的CPMD模擬中設(shè)置了 STORE 100 這個關(guān)鍵詞來設(shè)定每100步來寫一次RESTART文件。如果你沒有設(shè)置STORE，那么你完了，基本不可能繼續(xù)跑了，只能從TRAJECTORY中找到最后保存你的幾何，重新做波函數(shù)優(yōu)化和溫度初始化，然后接著跑。但是這樣基本就跟前面的采樣沒有太大的時間連續(xù)性。 如果你下面打算設(shè)置STORE關(guān)鍵詞，建議你不要設(shè)置的太頻繁，因為RESTART文件非常大，我的200原子體系大約有1G，頻繁寫RESTART的話會嚴(yán)重影響計算速度。如果服務(wù)器穩(wěn)定，設(shè)個1000步就差不多了；服務(wù)器不穩(wěn)定的話，設(shè)個200或500. |
2樓2012-05-31 06:25:54
雪靈
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3樓2012-05-31 07:47:55
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雪靈4樓2012-05-31 08:24:00
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5樓2012-05-31 10:39:34
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6樓2013-05-29 09:43:42
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7樓2013-07-18 04:05:03
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