 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 9 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1480 | 回復(fù): 8 | |||
[求助]
ADF在linux下安裝的并行設(shè)置
|
|
一般的設(shè)置都不會出問題，也不會提示出錯，但是發(fā)現(xiàn)了ADF運(yùn)行的一個奇怪的地方： 在任務(wù)剛開始運(yùn)行的時(shí)候是一個核在計(jì)算的，然后在特定的階段才會使用設(shè)定NSCM的核數(shù)進(jìn)行算。 以前在一個集群里面有這個問題，就使用自帶的ADF的mpi，問題就解決了。從一開始就是按照設(shè)定的NSCM計(jì)算的，速度有了明顯的提升，mpi部分設(shè)置是這樣的： export PATH=$PATH:/home/zhou/soft/adf/adf2010.02/bin/platform_mpi/bin export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/zhou/soft/adf/adf2010.02/bin/platform_mpi/lib/linux_amd64 export MPIRUN_OPTIONS=-TCP 其他設(shè)置見2樓 這個服務(wù)器是suse系統(tǒng)的 后來買了個新的集群，安裝的都是CentOS。因?yàn)橹繿df這個問題，所以最開始在提交任務(wù)的腳本中就設(shè)置使用a自帶的mpi，也沒什么問題。 但是最近由于使用vasp等軟件，把環(huán)境變量改動了一部分，分別換了openmpi和intelmpi。后來又用到adf，就又把環(huán)境變量換回來了，但是問題就出現(xiàn)了！每個任務(wù)一開始很長時(shí)間都只有一個adf進(jìn)程在算，運(yùn)行一段時(shí)間后，才使用設(shè)定的核數(shù)計(jì)算。計(jì)算任務(wù)也可以正常算完，但是計(jì)算慢了很多。 我把環(huán)境變量中PATH和LD_LIBRARY_PATH都清空，然后重新設(shè)置。但是問題還是沒有解決。特向大家求助！希望用過adf的同志們幫幫忙！謝謝！ 也歡迎交流，參與討論就有BB，解決問題的答案還有更多額外的獎勵。 [ Last edited by 賀儀 on 2012-6-24 at 21:18 ] |
回復(fù)此樓» 本帖@通知
» 猜你喜歡
[電子教材]天津大學(xué)物理化學(xué)（第七版）上、下冊
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
半透性容器進(jìn)行高濕或者低濕研究
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有100人回復(fù)
-
陰離子交換膜電解二氧化碳還原
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
九江學(xué)院2026年最新高層次人才招聘公告
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
深圳信息職業(yè)技術(shù)學(xué)院2026年教師招聘公告（最新）
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
求ENDNOTE破解軟件安裝包
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
研究生招生
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
河海大學(xué) （211.雙一流高校）鈣鈦礦光電實(shí)驗(yàn)室丁勇團(tuán)隊(duì)歡迎有志青年！
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
黑龍江省原子能研究院化學(xué)課題組招收2026級化學(xué)專業(yè)或化學(xué)相關(guān)專業(yè)碩士生
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
山西大學(xué)資源與環(huán)境工程研究所化工分離/環(huán)境功能材料小組招收2026年博士生
已經(jīng)有2人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 請問MS-linux-cluster安裝之后無法并行的問題？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 請教MS4.4 Linux下安裝提示 msiinstall語法錯誤
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【整理】今天整理硬盤上的資料，偶然發(fā)現(xiàn)的好玩的小東西就直接發(fā)上來吧
已經(jīng)有105人回復(fù)
- 【求助】誰能幫我解決在linux下安裝ms出現(xiàn)的問題啊
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】能同時(shí)在linux系統(tǒng)下安裝g09和g03嗎？
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【原創(chuàng)】MS 5.0 LINUX 版小集群并行安裝手記
已經(jīng)有47人回復(fù)
- 【求助】MS在LINUX下的安裝問題
已經(jīng)有22人回復(fù)
- 【資源】ADF軟件linux下的安裝與參數(shù)設(shè)定
已經(jīng)有33人回復(fù)
- 【分享】在linux下安裝ms4.4
已經(jīng)有65人回復(fù)
|
export ADFHOME=/home/zhou/soft/adf/adf2010.02 #export ADFHOME=/home/zhou/soft/adf/2007/adf2007.01 export PATH=$PATH:$ADFHOME/bin export ADFBIN=$ADFHOME/bin export ADFRESOURCES=$ADFHOME/atomicdata export SCMLICENSE=$ADFHOME/license.txt export SCM_TMPDIR=/tmp export SCM_RESULTDIR=$ADFHOME/result export NSCM=12 |
2樓2012-06-24 20:49:48
wntc
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 3128.8
- 散金: 182
- 紅花: 5
- 帖子: 436
- 在線: 434.5小時(shí)
- 蟲號: 1124919
- 注冊: 2010-10-17
- 專業(yè): 化學(xué)信息學(xué)
★ ★
gmy1990: 金幣+2 2012-06-25 11:20:22
gmy1990: 金幣+2 2012-06-25 11:20:22
|
需要設(shè)置這么多么，我這似乎souce一下adfrc.sh就好了 My jobs 144803 are running on node71 PID TTY TIME CMD 27938 ? 00:00:00 bash 27966 ? 00:00:00 bash 27972 ? 00:00:00 job1.run 27973 ? 00:00:00 adf 27987 ? 00:00:00 runscript 28012 ? 00:00:00 start 28018 ? 00:00:00 mpirun.mpich 28021 ? 00:00:00 mpid 28135 ? 00:19:37 adf.exe 28136 ? 00:19:37 adf.exe 28137 ? 00:19:37 adf.exe 28138 ? 00:19:37 adf.exe 28139 ? 00:19:36 adf.exe 28140 ? 00:19:37 adf.exe 28141 ? 00:19:38 adf.exe 28142 ? 00:19:36 adf.exe 29642 ? 00:00:00 ps My jobs 144804 are running on node72 PID TTY TIME CMD 19894 ? 00:00:00 bash 19922 ? 00:00:00 bash 19928 ? 00:00:00 job2.run 19929 ? 00:00:00 adf 19943 ? 00:00:00 runscript 19968 ? 00:00:00 start 19974 ? 00:00:00 mpirun.mpich 19977 ? 00:00:00 mpid 20091 ? 00:19:38 adf.exe 20092 ? 00:19:37 adf.exe 20093 ? 00:19:38 adf.exe 20094 ? 00:19:38 adf.exe 20095 ? 00:19:38 adf.exe 20096 ? 00:19:38 adf.exe 20097 ? 00:19:37 adf.exe 20098 ? 00:19:36 adf.exe 21598 ? 00:00:00 ps |
3樓2012-06-24 22:04:44
4樓2012-06-24 22:14:12
wntc
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 3128.8
- 散金: 182
- 紅花: 5
- 帖子: 436
- 在線: 434.5小時(shí)
- 蟲號: 1124919
- 注冊: 2010-10-17
- 專業(yè): 化學(xué)信息學(xué)
5樓2012-06-25 10:56:20
6樓2012-06-25 17:04:30
abbott
金蟲 (著名寫手)
不要用QQ問我東西
- 應(yīng)助: 16 (小學(xué)生)
- 金幣: 1071.6
- 散金: 2787
- 紅花: 10
- 帖子: 1015
- 在線: 105.2小時(shí)
- 蟲號: 452267
- 注冊: 2007-11-05
- 性別: GG
- 專業(yè): 計(jì)算機(jī)硬件技術(shù)
7樓2012-06-27 21:19:56
8樓2012-06-27 21:54:32
9樓2012-06-27 21:54:54
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 賀儀 的主題更新
| 9 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿南京理工大學(xué)085701資源與環(huán)境302分求調(diào)劑 +3 | 葵梓衛(wèi)隊(duì) 2026-03-18 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 材料專碩274一志愿陜西師范大學(xué)求調(diào)劑 +8 | 薛云鵬 2026-03-13 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 085601材料工程專碩求調(diào)劑 +10 | 慕寒mio 2026-03-16 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 本人考085602 化學(xué)工程 專碩 +17 | 不知道叫什么！ 2026-03-15 | 19/950 |
|
|
|
[考研] 材料080500調(diào)劑求收留 +4 | 一顆meteor 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué) 305求調(diào)劑 +4 | FY_yy 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
[考研] 344求調(diào)劑 +6 | knight344 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 【同濟(jì)軟件】軟件（085405）考研求調(diào)劑 +3 | 2026eternal 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 收復(fù)試調(diào)劑生 +4 | 雨后秋荷 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 070300化學(xué)319求調(diào)劑 +6 | 錦鯉0909 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +3 | 妮妮ninicgb 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料，紡織，生物（0856、0710），化學(xué)招生啦 +3 | Eember. 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 278求調(diào)劑 +5 | 煙火先于春 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考博] 26博士申請 +3 | 1042136743 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 301求調(diào)劑 +4 | A_JiXing 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 考研化學(xué)學(xué)碩調(diào)劑，一志愿985 +4 | 張vvvv 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考博] 26申博 +4 | 八6八68 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +3 | 淇ya_~ 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工 求調(diào)劑 +13 | enenenhui 2026-03-13 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 0856專碩279求調(diào)劑 +5 | 加油加油！? 2026-03-15 | 5/250 |
|