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DMandMD金蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
如何從PDB數(shù)據(jù)庫(kù)中選擇合適的靶標(biāo)
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做一個(gè)對(duì)接。老板只告訴是EGFR做靶標(biāo)，具體很多都沒(méi)說(shuō)。結(jié)果在PDB數(shù)據(jù)庫(kù)上隨便一搜，Epidermal Growth Factor Receptor出來(lái)上百個(gè)。請(qǐng)問(wèn)高手如何從中選擇自己合適的藥物靶標(biāo)？我的配體是個(gè)兩個(gè)苯環(huán)的小分子…… 具體的流程如何呢？ |
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wangtj198781
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2樓2012-06-27 23:10:44
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【答案】應(yīng)助回帖
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DMandMD: 金幣+5, ★★★很有幫助 2012-07-05 08:33:14
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EGFr的晶體結(jié)構(gòu)選擇除了樓上說(shuō)的選人的和分辨率高的外： 1、分清是active or inactive類型。 2、選擇配體結(jié)構(gòu)類似的蛋白晶體結(jié)構(gòu)。 Active類型 PDB:2ITY Iressa®, Gefitinib, (ZD-1839) AstraZeneca PDB:1M17 Tarceva®, Erlotinib, (OSI-774) OSI / Genentech / Roche Inactive類型 PDB:1XKK Lapatinib, Tykerb®, (GW 572016) GSK PDB:2JIV Neratinib, (HKI-272, CPD-820) Wyeth |
3樓2012-06-28 09:17:09
wendaoliuxu
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6樓2012-06-28 10:30:47
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8樓2012-06-28 12:09:25
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10樓2012-06-29 09:25:34
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