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DMandMD金蟲 (初入文壇)
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[求助]
如何從PDB數(shù)據(jù)庫中選擇合適的靶標(biāo)
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做一個(gè)對接。老板只告訴是EGFR做靶標(biāo)，具體很多都沒說。結(jié)果在PDB數(shù)據(jù)庫上隨便一搜，Epidermal Growth Factor Receptor出來上百個(gè)。請問高手如何從中選擇自己合適的藥物靶標(biāo)？我的配體是個(gè)兩個(gè)苯環(huán)的小分子…… 具體的流程如何呢？ |
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caixin5120 
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wangtj198781
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2樓2012-06-27 23:10:44
caixin5120
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EGFr的晶體結(jié)構(gòu)選擇除了樓上說的選人的和分辨率高的外： 1、分清是active or inactive類型。 2、選擇配體結(jié)構(gòu)類似的蛋白晶體結(jié)構(gòu)。 Active類型 PDB:2ITY Iressa®, Gefitinib, (ZD-1839) AstraZeneca PDB:1M17 Tarceva®, Erlotinib, (OSI-774) OSI / Genentech / Roche Inactive類型 PDB:1XKK Lapatinib, Tykerb®, (GW 572016) GSK PDB:2JIV Neratinib, (HKI-272, CPD-820) Wyeth |
3樓2012-06-28 09:17:09
wendaoliuxu
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4樓2012-06-28 09:19:35
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