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histoday新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
PCR擴(kuò)增融合基因
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| 新手:一個(gè)新的融合基因,想把它的全長(zhǎng)擴(kuò)出來(lái),大約2000多kb,已經(jīng)試過(guò)很多次,都沒(méi)有結(jié)果。想聽(tīng)聽(tīng)大家的意見(jiàn)。比如用什么酶比較好?我用過(guò)普通taq酶,La taq酶,platinum,也重新設(shè)計(jì)過(guò)多次引物,但還是不行,想請(qǐng)教一下大家,謝謝! |
鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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有幾個(gè)可能的原因: 1.酶的問(wèn)題,采用延伸能力比較強(qiáng)的酶 2.引物問(wèn)題,看看引物之間以及本身的配對(duì)堿基情況 3.模板問(wèn)題,GC含量高或者產(chǎn)生內(nèi)部形成復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu),考慮使用GC buffer以及擴(kuò)增體系中加入甘油等物質(zhì) 4.退火溫度過(guò)低或者循環(huán)數(shù)偏少,提高退火溫度以及加大循環(huán)數(shù) |
新蟲(chóng) (小有名氣)
新蟲(chóng) (初入文壇)
新蟲(chóng) (初入文壇)
| 樓主給的信息很少,包括基因分析,gc含量也沒(méi)說(shuō),沒(méi)擴(kuò)出來(lái)的圖是什么樣的也沒(méi)有,高gc要把退火溫度調(diào)高一些,如果平均gc在70%以上,建議你變性時(shí)間延長(zhǎng),退火溫度用68度試一試。還可以在預(yù)變性結(jié)束后再加酶,確保酶不會(huì)應(yīng)為長(zhǎng)時(shí)間高溫而變性。 |
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