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AMBER中能量優(yōu)化和模擬的條件怎么選擇呢？
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| AMBER模擬前的能量優(yōu)化一般要優(yōu)化到什么程度可以進(jìn)行模擬了呢？還有模擬的條件大家是怎么選擇的？比如步長，步數(shù)什么的？我是新手，一點(diǎn)概念也沒有，求指教啊。 |
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vip_zzc
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2樓2012-07-18 15:13:59
lujunyan1118
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chaizhm: 金幣+2, 謝謝~ 2012-08-21 19:21:05
903566945: 金幣+2 2012-08-27 08:57:41
chaizhm: 金幣+2, 謝謝~ 2012-08-21 19:21:05
903566945: 金幣+2 2012-08-27 08:57:41
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http://ambermd.org/tutorials/ g跟著這個(gè)教程做，做完前幾個(gè)教程就會有感覺了。另外看看別人文獻(xiàn)里的方法部分 不同體系是不太一樣的， 沒有統(tǒng)一的答案，還是從基礎(chǔ)的入手，然后融會貫通 |
3樓2012-08-20 12:35:24
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