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[求助]
原核載體構(gòu)建
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求助: 我現(xiàn)在在構(gòu)建一個原核載體,是氯霉素抗性的,我用的是KpnI,XbaI這兩個酶,我一直用的傳統(tǒng)的方法,可就是連不上,PCR回收在酶切,質(zhì)粒酶切,單酶切,都試過了,就是連不上,請問高手們,有沒有遇到過這樣的問題啊1 |



金蟲 (正式寫手)


金蟲 (正式寫手)

金蟲 (小有名氣)
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克隆不成功最常見的原因是載體或PCR產(chǎn)物酶切不完全。 載體酶切時,最難得部分是如何判斷載體是否完全酶切的方法,因為只有載體的完全雙酶切,才能保證較高的克隆效率,減少假陽性。 一般來說,可以通過電泳分析來初步判斷是否完全酶切: 1)如果你的載體上兩個酶切位點間有一個較大的片段(大于300bp),那么一般通過電泳帶型很容易判斷出雙酶切的效率,因為單切和雙切后的載體大小是不一樣的,而且還有酶切后產(chǎn)生的小片段提供參考。 2)如果你的載體上兩個酶切位點很靠近,如大部分載體的多克隆位點序列。那么判斷載體是否完全雙酶切就比較麻煩。一般比較科學(xué)的方法是設(shè)置兩種單酶切對照。即比照雙酶切體系,分別進(jìn)行實驗所用的兩種酶的單酶切,然后與雙酶切樣品同時進(jìn)行電泳分析,注意,電泳時還需要設(shè)置未酶切的質(zhì)粒對照。通過電泳的帶型來判斷在設(shè)定的酶切條件下(包括質(zhì)量用量,buffer,酶的用量等),酶切是否完全。 3)而PCR產(chǎn)物的酶切效率通常很難判斷,常用的電泳檢測方法也不適用。但PCR產(chǎn)物的酶切還是有一些基本的原則,如: A: 由于PCR產(chǎn)物的分子通產(chǎn)較載體分子小,因而在進(jìn)行PCR產(chǎn)物酶切是,建議用較少的PCR產(chǎn)物(300-500ng)進(jìn)行酶切, B:而且通常PCR產(chǎn)物酶切時所用的酶量較載體酶切所需的酶量還要多(具體原因,可以參考各種限制性內(nèi)切酶的單位定義)。 事實上,由于限制性內(nèi)切酶單位定義的特殊性,不同的酶在實際使用時,所需的用量差別較大(如XbaI的用量就應(yīng)該比KpnI多10倍左右)。建議你使用一些能夠精確計算酶切時限制性內(nèi)切酶用量的軟件計算,確保載體和PCR酶切的完全和徹底。我在小木蟲上推薦過一個軟件(double digestion designer),你可以試一試 |


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個人有些想法: 1.先確保載體被切開,分別用你的兩種酶單酶切,雙酶切,然后跑膠,沒有問題再往下做。 2.再確認(rèn)下酶的說明書,PCR產(chǎn)物有些要求,是要切久一點的,不過,你切4h,應(yīng)該夠了。回收后的效率如何,PCR產(chǎn)物有多大?膠回收試劑盒的分辨率可以達(dá)到嗎? 3.確保連接酶沒有問題,我就試過一次連接酶壞了,做幾次都沒有出來。連接體系中,載體與目的片段如何? 4.確認(rèn)感受態(tài)木有問題. 希望對你有幫助! |
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