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celia2012銅蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
16S rRNA序列測(cè)定后如何查詢(xún)菌的種屬
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| 最近拿單菌落進(jìn)行菌落PCR后，拿到測(cè)序公司去測(cè)序，現(xiàn)在有結(jié)果了，有峰圖和序列圖，但不知道怎么鑒定好壞，還有如何通過(guò)基因序列鑒定菌種，還有誰(shuí)曉得��？萬(wàn)分感謝 |
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eagles123
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2樓2012-08-03 17:34:41
weiyasong
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3樓2012-08-03 17:36:23
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
celia2012: 金幣+3 2012-08-04 09:32:52
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| http://nocardia.nih.go.jp/fp4/ 這是韓國(guó)的一個(gè)菌種鑒定的二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)，和NCBI連接的，用起來(lái)很方便，結(jié)過(guò)比NCBI里Blast結(jié)果直觀一些，但是只包括了標(biāo)準(zhǔn)菌株。使用的時(shí)候需要注冊(cè)一下，填上郵箱即可，還能自動(dòng)保存檢索結(jié)果 推薦新手使用，在框里貼上序列，然后點(diǎn)cookin'就可以了 |
6樓2012-08-04 09:20:42
celia2012
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8樓2012-08-04 10:22:30
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9樓2012-08-04 10:23:59
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10樓2012-08-04 10:41:21
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