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wygcsu木蟲(chóng) (小有名氣)
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[交流]
系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)bootsrap 已有5人參與
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為什么在構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)時(shí)，一些節(jié)點(diǎn)沒(méi)有bootsrap值，不知道什么意思，是可靠還是不可靠？bootsrap值究竟代表什么意思？是怎么得來(lái)的？為什么有的是幾百，有的樹(shù)卻是幾十？求大俠們解釋 [ Last edited by wygcsu on 2012-8-6 at 09:38 ] |
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Bootstrap（進(jìn)化樹(shù)） 即自展值，是用來(lái)檢驗(yàn)?zāi)闼?jì)算的進(jìn)化樹(shù)分支可信度的。簡(jiǎn)單地講就是把序列的位點(diǎn)都重排，重排后的序列再用相同的辦法構(gòu)樹(shù)，如果原來(lái)樹(shù)的分枝在重排后構(gòu)的樹(shù)中也出現(xiàn)了，就給這個(gè)分枝打上一分，如果沒(méi)出現(xiàn)就給0分，這樣經(jīng)過(guò)你給定的repetitions次（至少1000次）重排構(gòu)樹(shù)打分后，每個(gè)分枝就都得出分值，計(jì)算機(jī)會(huì)給你換算成bootstrap值。重排的序列有很多組合，值越小說(shuō)明分枝的可信度越低，最好根據(jù)數(shù)據(jù)的情況選用不同的構(gòu)樹(shù)方法和模型. |
9樓2014-07-03 09:29:01
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