 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 10 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1877 | 回復(fù): 9 | |||
bisimai1025銅蟲(chóng) (初入文壇)
|
[求助]
急求序列結(jié)構(gòu)分析
|
| 實(shí)驗(yàn)線粒體DNA序列拼接出來(lái)了，要分析基因序列的結(jié)構(gòu)（編碼基因，tRNA基因和rRNA基因）但是我不知道用什么軟件去分析~~求好心人幫忙！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
材料求調(diào)劑 一志愿哈工大總分298分，前三科223分
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
085600 286分 材料求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
086502化學(xué)工程342求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
材料求調(diào)劑一志愿哈工大324
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
328求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
340求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
求調(diào)劑推薦 材料 304
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
291求調(diào)劑
已經(jīng)有19人回復(fù)
-
331環(huán)境科學(xué)與工程求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 蛋白3D結(jié)構(gòu)，序列分析軟件Cn3DM中文說(shuō)明書(shū)，
已經(jīng)有50人回復(fù)
- 如果蛋白序列N或者C末端多了6個(gè)組氨酸，怎么分析蛋白結(jié)構(gòu)呢？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 急求統(tǒng)計(jì)分析問(wèn)題！
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 問(wèn)個(gè)泛函分析的問(wèn)題， 有關(guān)序列極限，略難。。。
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 求助序列分析BLAST最簡(jiǎn)潔的教程
已經(jīng)有19人回復(fù)
- 蛋白氨基酸序列分析及二、三、四級(jí)結(jié)構(gòu)的鑒定
已經(jīng)有33人回復(fù)
- 急求幫助：共聚水凝膠的結(jié)構(gòu)和彼此之間的相互作用力的判斷表征方法手段有哪些啊
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【急求助】Raman、PL對(duì)材料結(jié)構(gòu)的分析
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 急求：得到蛋白質(zhì)后，想對(duì)其進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)的檢測(cè)，求方法和機(jī)構(gòu)
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 急求一段晶體結(jié)構(gòu)分析的翻譯
已經(jīng)有2人回復(fù)
- 【求助/交流】基因序列的分析
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助】氨基酸序列三維結(jié)構(gòu)的獲得
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【推薦】序列對(duì)齊分析
已經(jīng)有14人回復(fù)
hanxiaoyang0 
銀蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 556.9
- 帖子: 46
- 在線: 35.4小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1532030
- 注冊(cè): 2011-12-10
- 性別: MM
- 專(zhuān)業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
yqbter: 金幣+2, 鼓勵(lì)發(fā)帖！ 2012-08-16 13:25:09
bisimai1025: 金幣+4, ★有幫助 2012-08-17 20:43:23
wizardfan: 以后引用別人的網(wǎng)站，請(qǐng)注明 2012-08-17 22:00:59
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
yqbter: 金幣+2, 鼓勵(lì)發(fā)帖！ 2012-08-16 13:25:09
bisimai1025: 金幣+4, ★有幫助 2012-08-17 20:43:23
wizardfan: 以后引用別人的網(wǎng)站，請(qǐng)注明 2012-08-17 22:00:59
|
Antheprot：蛋白質(zhì)序列分析軟件包ANTHEPROT 4.5是位于法國(guó)的蛋白質(zhì)生物與化學(xué)研究院（Institute of Biology and Chemistry of Proteins）用十多年時(shí)間開(kāi)發(fā)出的蛋白質(zhì)研究軟件包。軟件包包括了蛋白質(zhì)研究領(lǐng)域所包括的大多數(shù)內(nèi)容，功能非常強(qiáng)大。應(yīng)用此軟件包，使用個(gè)人電腦，便能進(jìn)行各種蛋白序列分析與特性預(yù)測(cè)。更重要的是該軟件能夠提供蛋白序列的一些二級(jí)結(jié)構(gòu)信息，使用戶有可能模擬出未知蛋白的高級(jí)結(jié)構(gòu)。 Applied Biosystems Primer Express：這是ABI公司銷(xiāo)售附送的軟件，可用于設(shè)計(jì)引物和探針，尤其適用于熒光PCR探針的設(shè)計(jì)，可以精確計(jì)算寡核苷酸與熒光基團(tuán)鰲合后的Tm值�？梢灶A(yù)測(cè)引物與引物之間與模板之間等的二級(jí)結(jié)構(gòu)。 Artemis R5：A DNA sequence viewer and annotation tools，一個(gè)DNA序列查看器與注釋工具，可以以圖形形式查看序列的各種分析結(jié)果與特性，程序讀取EMBL與GENBANK格式的序列與純DNA序列。以Java寫(xiě)成，需要安裝JRE1.2。 BioEdit是一個(gè)序列編輯器與分析工具軟件，功能非常強(qiáng)大，使用十分容易。功能包括：序列編輯、外掛分析程序、RNA分析、尋找特征序列、支持超過(guò)20000個(gè)序列的多序列文件、基本序列處理功能、質(zhì)粒圖繪制等等。 BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)或DNA數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行相似性比較的分析工具。BLAST程序能迅速與公開(kāi)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行相似性序列比較。BLAST結(jié)果中的得分是對(duì)一種對(duì)相似性的統(tǒng)計(jì)說(shuō)明。BLAST對(duì)一條或多條序列(可以是任何形式的序列)在一個(gè)或多個(gè)核酸或蛋白序列庫(kù)中進(jìn)行比對(duì)。BLAST還能發(fā)現(xiàn)具有缺口的能比對(duì)上的序列。 BLAST是基于Altschul等人在J.Mol.Biol上發(fā)表的方法(J.Mol.Biol.215:403-410(1990)),在序列數(shù)據(jù)庫(kù)中對(duì)查詢序列進(jìn)行同源性比對(duì)工作。從最初的BLAST發(fā)展到現(xiàn)在NCBI提供的BLAST2.0,已將有缺口的比對(duì)序列也考慮在內(nèi)了。BLAST可處理任何數(shù)量的序列,包括蛋白序列和核算序列;也可選擇多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)但數(shù)據(jù)庫(kù)必須是同一類(lèi)型的,即要么都是蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)要么都是核酸數(shù)據(jù)庫(kù)。所查詢的序列和調(diào)用的數(shù)據(jù)庫(kù)則可以是任何形式的組合,既可以是核酸序列到蛋白庫(kù)中作查詢,也可以是蛋白序列到蛋白庫(kù)中作查詢,反之亦然。 1、BLASTP是蛋白序列到蛋白庫(kù)中的一種查詢。庫(kù)中存在的每條已知序列將逐一地同每條所查序列作一對(duì)一的序列比對(duì)。 2、BLASTX是核酸序列到蛋白庫(kù)中的一種查詢。先將核酸序列翻譯成蛋白序列（一條核酸序列會(huì)被翻譯成可能的六條蛋白），再對(duì)每一條作一對(duì)一的蛋白序列比對(duì)。 3、BLASTN是核酸序列到核酸庫(kù)中的一種查詢。庫(kù)中存在的每條已知序列都將同所查序列作一對(duì)一地核酸序列比對(duì)。 4、TBLASTN是蛋白序列到核酸庫(kù)中的一種查詢。與BLASTX相反，它是將庫(kù)中的核酸序列翻譯成蛋白序列，再同所查序列作蛋白與蛋白的比對(duì)。 5、TBLASTX是核酸序列到核酸庫(kù)中的一種查詢。此種查詢將庫(kù)中的核酸序列和所查的核酸序列都翻譯成蛋白（每條核酸序列會(huì)產(chǎn)生6條可能的蛋白序列），這樣每次比對(duì)會(huì)產(chǎn)生36種比對(duì)陣列。 Clone：與primer同屬一類(lèi)軟件，軟件，綠色，無(wú)需安裝�？蛇M(jìn)行酶切圖譜分析，質(zhì)粒描繪。 Clustal X 用來(lái)對(duì)核酸與蛋白序列進(jìn)行多序列比較（multiple sequence alignment）的軟件。多序列比較在分子生物學(xué)中是一個(gè)基本方法，用來(lái)發(fā)現(xiàn)特征序列，進(jìn)行蛋白分類(lèi)，證明序列間的同源性，幫助預(yù)測(cè)新序列二級(jí)結(jié)構(gòu)與三級(jí)結(jié)構(gòu)，確定PCR引物，以及在分子 進(jìn)化分析方面均有很大幫助，Clustal X很適合這些方面的要求。 DNAClub： DNA Club是一個(gè)簡(jiǎn)單的對(duì)DNA進(jìn)行與PCR有關(guān)的操作的軟件。它的功能有： 1、輸入DNA序列； 2、查找ORF序列； 3、把DNA翻譯成蛋白序列； 4、查找酶切位點(diǎn)； 5、查找PCR引物序列。 功能雖然都很簡(jiǎn)單，但非常實(shí)用，一般的用戶都可以很方便地使用。 DNAMan：綜合分析軟件，可進(jìn)行限制酶分析，引物設(shè)計(jì)，對(duì)排（aligment）,翻譯，數(shù)據(jù)庫(kù)操作，Blast，序列裝配（Sequence assembly）。 |
2樓2012-08-16 10:42:21
wizardfan
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
- BioEPI: 18
- 應(yīng)助: 599 (博士)
- 貴賓: 1.818
- 金幣: 24632.2
- 散金: 197
- 紅花: 48
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 2254
- 在線: 400.7小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1879241
- 注冊(cè): 2012-07-05
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 生物信息學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
bisimai1025: 金幣+6, ★有幫助 2012-08-20 08:45:04
bisimai1025: 金幣+4 2012-08-24 09:32:21
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
bisimai1025: 金幣+6, ★有幫助 2012-08-20 08:45:04
bisimai1025: 金幣+4 2012-08-24 09:32:21
|
補(bǔ)充2樓忘記的引用網(wǎng)址 http://news.biox.cn/content/200812/20081201133723_21115.shtml [ Last edited by wizardfan on 2012-8-17 at 08:47 ] |
3樓2012-08-17 08:20:32
bisimai1025
銅蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 48.8
- 散金: 20
- 紅花: 3
- 帖子: 45
- 在線: 27.5小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1461328
- 注冊(cè): 2011-10-26
- 性別: MM
- 專(zhuān)業(yè): 生物化學(xué)
4樓2012-08-17 10:05:50
wizardfan
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
- BioEPI: 18
- 應(yīng)助: 599 (博士)
- 貴賓: 1.818
- 金幣: 24632.2
- 散金: 197
- 紅花: 48
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 2254
- 在線: 400.7小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1879241
- 注冊(cè): 2012-07-05
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 生物信息學(xué)
bisimai10255樓2012-08-17 16:25:49
bisimai1025
銅蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 48.8
- 散金: 20
- 紅花: 3
- 帖子: 45
- 在線: 27.5小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1461328
- 注冊(cè): 2011-10-26
- 性別: MM
- 專(zhuān)業(yè): 生物化學(xué)
6樓2012-08-17 20:42:52
wizardfan
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
- BioEPI: 18
- 應(yīng)助: 599 (博士)
- 貴賓: 1.818
- 金幣: 24632.2
- 散金: 197
- 紅花: 48
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 2254
- 在線: 400.7小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1879241
- 注冊(cè): 2012-07-05
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 生物信息學(xué)
7樓2012-08-17 20:46:23
bisimai1025
銅蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 48.8
- 散金: 20
- 紅花: 3
- 帖子: 45
- 在線: 27.5小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1461328
- 注冊(cè): 2011-10-26
- 性別: MM
- 專(zhuān)業(yè): 生物化學(xué)
8樓2012-08-17 21:13:27
wizardfan
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
- BioEPI: 18
- 應(yīng)助: 599 (博士)
- 貴賓: 1.818
- 金幣: 24632.2
- 散金: 197
- 紅花: 48
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 2254
- 在線: 400.7小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1879241
- 注冊(cè): 2012-07-05
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 生物信息學(xué)
9樓2012-08-17 21:53:10
bisimai1025
銅蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 48.8
- 散金: 20
- 紅花: 3
- 帖子: 45
- 在線: 27.5小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1461328
- 注冊(cè): 2011-10-26
- 性別: MM
- 專(zhuān)業(yè): 生物化學(xué)
10樓2012-08-17 22:13:53
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 bisimai1025 的主題更新
| 10 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料求調(diào)劑 一志愿哈工大總分298分，前三科223分 +5 | dongfang59 2026-03-27 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 0703化學(xué)求調(diào)劑，各位老師看看我�。。� +5 | 祁祺祺 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
[考研] 274求調(diào)劑 +17 | 顧九笙要謙虛 2026-03-24 | 23/1150 |
|
|
|
[考研] 279 分 求調(diào)劑 +4 | 睡個(gè)好覺(jué)_16 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 305求調(diào)劑 +5 | 哇盧卡庫(kù) 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿211，335分，0856，求調(diào)劑院校和導(dǎo)師 +4 | 傾____蕭 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研]
 材料與化工考研調(diào)劑
+16
|
孅華 2026-03-22 | 16/800 |
|
|
|
[論文投稿] Journal of Mechanical Science and Technology +3 | Russ_ss 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑求收留 +7 | 果然有我 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 324求調(diào)劑 +4 | wysyjs25 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 340求調(diào)劑 +5 | 話梅糖111 2026-03-24 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 食品專(zhuān)碩 一志愿雙一流 328 +3 | xiaom99 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 306求0703調(diào)劑一志愿華中師范 +10 | 紙魚(yú)ly 2026-03-21 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 292求調(diào)劑 +4 | 鵝鵝鵝額額額額?/a> 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)] 請(qǐng)教下大家 2026年國(guó)家基金申請(qǐng)是雙盲審嗎？ +3 | lishucheng1 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料/農(nóng)業(yè)專(zhuān)業(yè)，07/08開(kāi)頭均可，過(guò)線就行 +3 | 呵唔哦豁 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑 +4 | LHHL66 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 315分，誠(chéng)求調(diào)劑，材料與化工085600 +3 | 13756423260 2026-03-22 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué)調(diào)劑 +5 | Surekei 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料學(xué)碩301分求調(diào)劑 +7 | Liyouyumairs 2026-03-21 | 7/350 |
|