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zdwxxw至尊木蟲 (著名寫手)
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[求助]
新手入門,想問一下關(guān)于未知基因的表達(dá)
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| 如題,如果我知道一株菌有某種功能,但是相關(guān)的基因卻沒有報道過,如何才能把這個基因找出來克隆至模式菌株中表達(dá)? 新手入門,謝謝各位指教! |
基因克隆與表達(dá) |

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可以的。研究得少的東西容易出成果。我現(xiàn)在能想到的有兩種方法: 當(dāng)然,最先要做的是把這種菌株篩出來,因為一般的菌株并不會過量產(chǎn)一種酶,或者表達(dá)這種酶的高活性。如果你通過誘變甚至定向進(jìn)化的方法,可能是①解除其調(diào)控,使酶過量表達(dá);②酶活提高,酶學(xué)性質(zhì)也提高了。如果是①的情況,該酶本身的性質(zhì)可能并沒有改變,只是調(diào)控限制被解除了,但是做克隆表達(dá)也是可以嘗試的;如果是②的情況,說明酶的基因改變導(dǎo)致內(nèi)部結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,這種酶做克隆表達(dá)是很有價值的。但我認(rèn)為,無論哪種情況,都可以做克隆表達(dá)。然后怎樣獲得該酶基因,大概我知道的有兩種: (1)我上面所說的,你可以分析一下“少數(shù)幾種菌的產(chǎn)酶基因被報道過”的這些菌株中,該酶基因的一致程度,如果基因前面幾十個堿基和最后幾十個堿基是相似的,則可以根據(jù)這些序列設(shè)計(兼并)引物,以你篩出的菌的基因組為模版進(jìn)行pcr調(diào)出基因。后面的操作是很模式化的(不同實驗室有區(qū)別),pcr得到目的基因→膠回收→加A→純化→連接T載體→轉(zhuǎn)化JM109→保藏甘油管、提質(zhì)粒、質(zhì)粒測序→轉(zhuǎn)化表達(dá)載體→發(fā)酵做酶學(xué)性質(zhì)分析。 (2)如果你不知道基因,則需要將蛋白純化出來,測定蛋白N端、C端蛋白質(zhì)序列,根據(jù)序列設(shè)計兼并引物,按(1)的步驟調(diào)取基因。 應(yīng)該還有其他方法,你可以看看分子生物學(xué)的教材,看別人用什么方法調(diào)基因。 |
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通過文獻(xiàn)知道這種功能的代謝途徑,即確定是表達(dá)了哪個基因→在NCBI上查找此菌的其他亞類的此基因基因序列,通過對比序列設(shè)計引物(有可能是兼并引物)→提取此菌基因組,通過pcr獲得基因→與T載體連接,轉(zhuǎn)化入模式菌種→提出質(zhì)粒,測序→測序結(jié)果正確后,轉(zhuǎn)化入表達(dá)菌種。 這是一般流程,你要具體說明一下你的情況。 |
至尊木蟲 (著名寫手)

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