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mahoumeimei金蟲 (小有名氣)
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進(jìn)化樹及序列上傳相關(guān)問題
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向各位咨詢兩個(gè)問題： 1.畫進(jìn)化樹時(shí)，我下載的序列如果跟我的序列不一樣長，是不是需要額外的處理，將它們剪成相同的長度？如果是，一般用的什么軟件呢？ 2.序列上傳到數(shù)據(jù)庫時(shí)，是所有的序列都要上傳，還是需要去掉這些序列中相同的序列？比如，我一共拿到40條序列，但是這中間有十幾條是很相近的，基本可以認(rèn)為是一樣的，那么是不是在這十幾條中，我只需要上傳一條就行了？如果相同的序列就可以不用上傳，那么，認(rèn)為兩條序列相同的標(biāo)準(zhǔn)是什么？它們之間的比對(duì)超過幾個(gè)堿基不一樣就認(rèn)為是不同的了呢？ 期待各位的回復(fù)�。�！萬分感謝�。�！ |
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mahoumeimei
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1. 不需要裁剪，軟件自動(dòng)分析匹配度，比如MEGA 4或5 2. 對(duì)于很相似的序列，自己能確定來源是否相同嗎？來源相同的傳一個(gè)就行了吧，來源不同的話就都傳上去。如果不明白，直接發(fā)信詢問基因庫的人，他們?cè)谶@方面的經(jīng)驗(yàn)豐富，這種情況應(yīng)該也遇到過，Genebank上就有同一單位上傳的相似的序列。 |
2樓2012-09-19 01:35:04
mahoumeimei
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