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shuaiblue銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
求教晶體結(jié)構(gòu)中游離水的數(shù)目與cif文件分子式的不同，如何解決！謝謝~
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| 求教：用降低空間群的方法解出的晶體，在升高空間群之后，晶體結(jié)構(gòu)中顯示的是一個(gè)游離水分子，可是生成的cif文件里的分子式卻是兩個(gè)游離水分子，兩者不符，就像兩個(gè)水分子重疊了一樣，該如何解決呢？謝謝 |
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shuaiblue2樓2012-09-22 20:44:12
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linhua0402313: 金幣+1, 感謝回帖交流，歡迎常來晶體板塊 2012-09-23 09:48:55
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| 首先說沒有看到具體的結(jié)構(gòu)很難定論。如果兩個(gè)水的距離在化學(xué)上是合理的，可以考慮調(diào)整O原子的占有率，專業(yè)說法叫幾率占據(jù)，也就是在一個(gè)單胞里水分子在A處，在另一個(gè)單胞里，水分子在B處。如果兩個(gè)水分子的距離不合理，可能是晶胞定錯(cuò)了。建議用盡可能多的畫面重修晶胞，確保晶胞參數(shù)準(zhǔn)確，之后的結(jié)構(gòu)模型才有意義。另外，因?yàn)閱螒{衍射花樣不能確定有些空間群是有心還是無心的，建議在相應(yīng)的無心空間群下精修結(jié)構(gòu)，也許會有意想不到的結(jié)果。 |
4樓2012-09-22 22:57:00
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