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shuaiblue銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
求教晶體結(jié)構(gòu)中游離水的數(shù)目與cif文件分子式的不同,如何解決!謝謝~
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| 求教:用降低空間群的方法解出的晶體,在升高空間群之后,晶體結(jié)構(gòu)中顯示的是一個游離水分子,可是生成的cif文件里的分子式卻是兩個游離水分子,兩者不符,就像兩個水分子重疊了一樣,該如何解決呢?謝謝 |
至尊木蟲 (職業(yè)作家)
| 首先說沒有看到具體的結(jié)構(gòu)很難定論。如果兩個水的距離在化學(xué)上是合理的,可以考慮調(diào)整O原子的占有率,專業(yè)說法叫幾率占據(jù),也就是在一個單胞里水分子在A處,在另一個單胞里,水分子在B處。如果兩個水分子的距離不合理,可能是晶胞定錯了。建議用盡可能多的畫面重修晶胞,確保晶胞參數(shù)準(zhǔn)確,之后的結(jié)構(gòu)模型才有意義。另外,因為單憑衍射花樣不能確定有些空間群是有心還是無心的,建議在相應(yīng)的無心空間群下精修結(jié)構(gòu),也許會有意想不到的結(jié)果。 |

木蟲 (著名寫手)
銀蟲 (小有名氣)
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