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shuaiblue銀蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
求教晶體結(jié)構(gòu)中游離水的數(shù)目與cif文件分子式的不同,如何解決!謝謝~
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| 求教:用降低空間群的方法解出的晶體,在升高空間群之后,晶體結(jié)構(gòu)中顯示的是一個(gè)游離水分子,可是生成的cif文件里的分子式卻是兩個(gè)游離水分子,兩者不符,就像兩個(gè)水分子重疊了一樣,該如何解決呢?謝謝 |
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
銀蟲(chóng) (小有名氣)
至尊木蟲(chóng) (職業(yè)作家)
| 首先說(shuō)沒(méi)有看到具體的結(jié)構(gòu)很難定論。如果兩個(gè)水的距離在化學(xué)上是合理的,可以考慮調(diào)整O原子的占有率,專(zhuān)業(yè)說(shuō)法叫幾率占據(jù),也就是在一個(gè)單胞里水分子在A處,在另一個(gè)單胞里,水分子在B處。如果兩個(gè)水分子的距離不合理,可能是晶胞定錯(cuò)了。建議用盡可能多的畫(huà)面重修晶胞,確保晶胞參數(shù)準(zhǔn)確,之后的結(jié)構(gòu)模型才有意義。另外,因?yàn)閱螒{衍射花樣不能確定有些空間群是有心還是無(wú)心的,建議在相應(yīng)的無(wú)心空間群下精修結(jié)構(gòu),也許會(huì)有意想不到的結(jié)果。 |

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